20201125バイオロギング研究会ワークショップのスライドです。バイオロギングデータのデータペーパー化について紹介しています。

1. 生物多様性情報を論文として公開する
GBIFとデータペーパー
2020/11/25 バイオロギング研究会「オープンデータ」
東京都立大学 都市環境科学研究科
Ecological Research, Associate Editor in Chief
大澤 剛士<arosawa@tmu.ac.jp>
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2. アウトライン
• 自己紹介
• データペーパーって何？
• データペーパーとバイオロギング
• データペーパーの投稿

3. • 自己紹介
• データペーパーって何？
• データペーパーとバイオロギング
• データペーパーの投稿

4. 自己紹介
• 大澤 剛士 (Osawa Takeshi)
• 東京都立大学 都市環境科学研究科 准教授
• 専門は生物多様性情報学
• 巨大データベースに基づく生態学、
保全科学が主な研究テーマ

5. 自己紹介
生物多様性情報学？

6. 情報
科学
生物
多様性科学
情報学の技術を利用して
生物多様性に関連する
ありとあらゆる課題に取り込む
自己紹介

7. http://www.comp.tmu.ac.jp/biodiv_info_arosawa/
自己紹介

8. 日本の権威です(｀・ω´・)+
自己紹介

9. 生物多様性に関わるデータベースを
創って フィールドワーク、インターネット調査、博物館調査
使って
魅せる
ビッグデータ解析、シミュレーション、データ視覚化
見やすく使いやすい形で広く公開
自己紹介

10. ダ鳥獣ギ画
自己紹介
データを創って公開

11. インターネットを介して世界中の生物多様性情報を
オープン化しようという国際的取り組み
Global Biodiversity Information Facility
(GBIF)
GBIF (http://www.gbif.org/)
JBIF (www.gbif.jp/v2/)
自己紹介

12. 様々なデータセットを公開しています
自己紹介

13. 自己紹介
データを使った研究
ダ鳥獣ギ画

14. 自己紹介
最近の研究成果
小笠原における外来生物の管理優先度を検討（現地調査＆データベース解析）
Osawa et al. (2019)
Facilitation of management plan development via spatial classification of areas
invaded by alien invasive plant.
Biological Invasions 21: 2067-2080.
災害防止に貢献する半自然環境を検討（データベース解析）
Osawa et al. (2020)
High tolerance land use against flood disasters:
How paddy fields as previously natural wetland inhibit the occurrence of floods..
Ecological Indicators.
湿地性植物に安定的なハビタットを提供する水田の検討（データベース解析）
Osawa et al. (2020)
Paddy fields located in water storage zones could take over the wetland plant community.
Scientific Reports.
文化的サービスの評価（現地調査＆データベース解析）
Osawa et al. (2020)
Specimen based records and geographic locations of carabid beetles (Coleoptera)
collected mainly by Dr. Kazuo Tanaka.
Nature Conservation.

15. データを掘り起こして使う
自己紹介
ダ鳥獣ギ画

16. Ikeda K, Osawa T(2020) Predicting disease occurrence of cabbage
Verticillium wilt in monoculture using species distribution modeling.
PeerJ 8:e10290.
・嬬恋村のキャベツ病害
・発病状況のモニタリングデータ（紙地図）
・これを電子化して解析
紙で保管されていたデータを
掘り起こして電子化！
自己紹介

17. ・公開データを利用できれば
調査の手間が減る
・個人では得られない規模の
データが得られる
・専門外の分類群も扱える
自己紹介
ダ鳥獣ギ画

18. みんなでデータ公開
共有して幸せ★
ダ鳥獣ギ画
自己紹介

19. その意気や良し！
でも公開者のメリットは？
自己紹介

20. データペーパー

21. Osawa et al. (2020)
Specimen based records and geographic locations of carabid beetles (Coleoptera)
collected mainly by Dr. Kazuo Tanaka.
Ecological Research.
Osawa et al.（2017）A crowdsourcing approach to collecting photo-based insect and
plant observation records. Biodiversity Data Journal 5: e21271.
Osawa et al.（2017）Specimen records of spiders (Arachnida: Araneae)
by monthly census for 3 years in forest areas of Yakushima Island, Japan.
Biodiversity Data Journal 5: e14789.
大澤・和田（2016）市民参加による広域を対象とした生物調査の可能性-
近畿2府4県における駅のツバメ営巣調査結果およびデータ公開-.
Bird Research R1-R8.
Osawa et al.（2015）Agricultural land use 5- and 10-km mesh datasets
based on governmental statistics for 1970 – 2005. Ecological Research 30(5):757.
Voraphab et al.（2015）Insect species recorded in sugarcane fields of Khon Kaen
Province (Thailand) over three seasons in 2012. Ecological Research 30(3):415.
Osawa（2013）Monitoring records of plant species in the Hakone region of
Fuji-Hakone-Izu National Park, Japan, 2001-2010. Ecological Research 28(4):541.
データ公開論文（データペーパー）データはCC BY
論文としてデータを公開
・シンプルに業績になる
・利用者に引用される
データペーパー

22. Google Scholarとかで検索できる
データペーパーを引用することで、
そのデータを利用した研究ができる
 データペーパー：
データそのものを論文として公表する
データペーパー

23. ・何のデータか (what)
・いつ取ったデータか (when)
・どこで取ったデータか (where)
・誰がとったデータか (who)
・何のためのデータか
(研究プロジェクトとか (why)
・どうやって取ったデータか (how)
メタデータ
 データペーパー：
データそのものを論文として公表する
データ本体
+
データペーパー

24. Chavan and Lyubomir (2011)
再利用
出版（業績）
発掘
出版（業績）
1. 眠っているデータ発掘の促進
2. データ再利用の促進
3. データ公開に対するインセンティブ
 データペーパー：
データそのものを論文として公表する
データペーパー

25. メインで考えるより
副産物として捉えるとよいかも？
データペーパー

26. 論文発表済みのデータを改めていじること
終わったプロジェクトのデータを再解析すること
あまりないですよね
誰かに託せば新しい価値が
付加されるかも？いらすとや
データペーパー

27. 自分で使わなかったデータ（数が取れなかったサイト）
副産物で取得したデータ（対象種以外）
誰かが欲しがってるかも？
誰かに託せば新しい価値が
付加されるかも？いらすとや
データペーパー

28. 取ったデータ全部使うこと、
あまりないですよね
狙いどおりの結果が得られなかったり
天候でデータが穴あきになったり
査読者に切れって言われたり・・・
いらすとや
データペーパー

29. 原著論文を出した後、
あるいは同時にデータペーパーを投稿
・ Osawa (2013) Ecol.Res. 28(4):541
・ Osawa et al. (2015) Ecol.Res. 541.30(5):757
・ 大澤・和田（2016）Bird Research R1-8
○ 大澤・猪原（2008）保全生態学研究 13:179-186
○ Osawa et al. (2013) PLOS One: e79978
○ Osawa et al. (2016) Sci.Total Env. 542:478-483
○ Osawa (2015) Env. Man 55(5)1160-1167
原著論文
データペーパー
データペーパーには
原著で使わなかったデータを含めている
データペーパー

30. 最近は投稿時点でデータアーカイブを
求める雑誌も増えている
既にデータペーパーがあると
その処理も楽ちんです
https://datadryad.org/stash
データペーパー

31. 生物多様性データ（主には種の分布データ）は
GBIFで公開しつつデータペーパーに
JBIFにご相談ください
https://www.gbif.org/ja/dataset/c671d43f-7fb9-4b5a-a964-630bfbf47dd2
データペーパー

32. バイオロギングデータは
データペーパーになる？

33. Yoshida et al. (2020) Ecological Research 35: 1001-1008
Underwater video and still-image dataset of fishes and
other aquatic animals in Lake Biwa, Japan, observed via
carp-mounted video loggers
既になってます！
むしろすごい相性がいいと
感じています
バイオロギングとデータペーパー
ダ鳥獣ギ画

34. バイオロギングとデータペーパー
コイが観察した琵琶湖の生物
（行動観察データの副産物？）
いらすとや
https://www.nies.go.jp/biwakoi/index.html
# 鯉から目線

35. バイオロギングとデータペーパー
バイオロギングサイエンス：
電子技術による動物の生態・自然環境の解明
高い解像度での観察
定量化が実現
http://japan-biologgingsci.org/home/discipline/
ダ鳥獣ギ画

36. バイオロギングとデータペーパー
ローデータはもちろん
様々な二次データが生成できる
高解像度データは低解像度の情報を含む！
ロガーデータには少なくとも
・その生物の在情報
・生息場情報
・ライフサイクル
が含まれる
ビデオデータには他生物画像も映り込む
ダ鳥獣ギ画

37. 1粒で3度4度美味しいかも？
1. MOVEBANKへの登録
4. GBIFへの登録
2. 原著論文の発表
3. データペーパー発表

38. じゃあどこに投稿しよう？

39. https://www.gbif.org/data-papers
データペーパーの投稿
生物多様性関係なら
GBIFのwebサイトで調べられる

40. 日本生態学会英文誌
Ecological Research
（IF 1.58）

41.  2011年からデータペーパー受付
（生物系雑誌では古参）
https://esj-journals.onlinelibrary.wiley.com/
データペーパーの投稿

42. 最新号で初のデータペーパー特集
データペーパーの投稿

43. データペーパーの投稿
 原著論文等と同様に掲載されます
結果、考察の代わりに
データの詳細情報

44. Wiley購読契約者以外も
JaLTERシステムからアクセス可能
→広く読まれるポテンシャルあり
データペーパーの投稿
 データも預けることができます
（サイズ上限あり）

45. データペーパーの投稿
 外部リポジトリ等に置いておくこともOK
今回紹介した例が好例
私はGBIFと同時に公開しています

46. どんなデータなら
データペーパーになる？

47. エコリサ編集幹事（AEiC）として
・生態学データなら何でも受け付け
（行動データも歓迎）
・イントロに「生態学的な意義」をしっかり
説明せよ（原著書いてたら余裕？）
・分量、精度は「生態学的な意義」に依存
・事前相談も歓迎です（吉田さんも有）
みなさんの投稿お待ちしております

48. Take Home Messages
• データペーパーは（査読付き）論文の一形態
• バイオロギングデータは様々な二次情報を含む
• バイオロギングするなら（だいたい）同時に
データペーパーのネタができる
• せっかくなので1粒で2度3度おいしくいこう
• エコリサはあなたのデータペーパー投稿を
お待ちしております

49. ついでに・・
バイオロギングデータは素人ですが、
高解像度の観測データを使った
生態学研究に興味あります！
データ公開はもちろん、
生態学研究のコラボのお誘い大歓迎です。
東京都立大学
都市環境科学研究科
大澤 剛士
＜arosawa[at]tmu.ac.jp＞
ダ鳥獣ギ画