Este documento trata sobre las bases de la bioquímica. Explica que la bioquímica estudia las estructuras y funciones de los seres vivos en términos químicos, y que las biomoléculas interactúan y tienen funciones biológicas. También describe que la materia está constituida por átomos con subpartículas como protones, neutrones y electrones, y que los átomos se combinan para formar moléculas a través de enlaces químicos. Además, señala que los grupos func

1. LAS BASES DE LA BIOQUIMICA
Bioquímica, trata de explicar en términos químicos las estructuras y las funciones de los seres
vivos. Las biomoleculas interaccionas y tienen función biológica. La química orgánica es
considerada como la química del carbono y de sus compuestos.
La materia esta constituida por átomos
Átomos, una partícula de tamaño pequeño, tiene subparticulas, protón, neutrón y electrón. Los
átomos no presentan carga neta. Iones con una diferencia de carga.
Los protones y neutrones se localizan en el núcleo del átomo.
Los orbitales atómicos quedan definidos por números cuánticos.
Orbitales atómicos, son las zonas que rodean el núcleo. En el orbital encontramos números
cuánticos: numero cuántico principal (n), numero cuántico acimutal (l), numero cuántico
magnético (m) y numero spin (s).
¿Qué determina el orden de los elementos en la tabla periódica?
Se define de izquierda a derecha, según aumento el número de protones.
Los elementos se combinan y forman moléculas
La unión entre los átomos se establece a través de enlaces químicos y estos nuevos agregados
poliatómicos (moléculas). Las moléculas que están constituidas por átomos de diferentes
elementos se denominan compuestos. La configuración electrónica va a determinar su reactividad.
Los electrones de las últimas capas se conocen como electrones de valencia.
La electronegatividad, que es la tendencia que tienen los átomos de atraer hacia si el par de
electrones compartido. La distribución específica de los electrones dentro de una molécula se
denomina configuración electrónica.
Orbitales híbridos. La tetravalencia del carbono
Para los elementos del segundo periodo, los orbitales s y p de la última capa están tan próximos
en su nivel de energía que pueden interaccionar formando orbitales híbridos que combinan
caracteres de ambos orbitales.
Enlace covalente coordinado o dativo
En los enlaces, cada electrón del par de electrones compartido lo aporta uno de los átomos que
participa en el enlace, en algunos casos, el par de electrones compartido procede exclusivamente
de uno de los átomos, mientras que el otro aporta un orbital vacío.
Polaridad y enlaces polares

2. Cuando dos átomos de electronegatividad muy diferentes forman un enlace covalente, los
electrones no son compartidos en igual medida, se forma un enlace covalente polar, el átomo
electromagnetismo presenta una mayor densidad de carga negativa. El resultado es la formación
de un dipolo, es decir, dos cargas de signo opuesto separados por una distancia determinada.
Los grupos funcionales determinan las interacciones entre biomoléculas
Las moléculas biológicas pueden formar largas estructuras lineales, ramificadas e incluso cíclicas,
muy firmes. En las diferentes biomoleculas de los seres vivos se encuentran, de forma recurrente,
una serie de grupos funcionales. La naturaleza de estos grupos es determinante en el
funcionamiento de la molécula biológica.
Las interacciones débiles determinan, la función de la molécula.
Las moléculas deben interaccionar para comenzar una acción, y posteriormente separarse como la
replicación del ADN. Las interacciones débiles pueden ser naturaleza o hidrofobia. Las primeras
incluyen los puentes de hidrogeno, los puentes salinos y las fuerzas de van der Waals.
Enlace iónico o puente salino
Los iones van a establecer entre sí, interacciones de tipo electrostático, también denominadas
puente salino; estos en solución acuosa, pueden atraerse o repelerse según la carga que porten.
Los puentes salinos no son tan dependientes como los puentes de hidrógeno, de la distancia ni de
la orientación entre átomos.
Fuerzas de van der Waals
Son interacciones muy débiles que mantienen unidas temporalmente átomos o moléculas no
polares. También son de tipo carga-carga, pero dependiendo de la distancia entre átomos, En el
momento en que el electrón de un átomo se acerca o aleja del átomo con el que esta enlazado
son dipolos temporales.
Interacción hidrofóbica
No presentan naturaleza electrostática, se darán entre moléculas y grupos funcionales no polares.
Son fundamentales en la biología, ya que la naturaleza apolar de muchos componentes, les obliga
a mantenerse unidos, formando distintas estructuras.
Química de los ácidos y de las bases
El comportamiento de la ionización del agua es la base para comprender el concepto de acido y
base. Base es una sustancia con un par de electrones disponibles para formar un enlace covalente
dativo y un ácido es una molécula en la que existe un átomo capaz de aceptar un par de electrones
ya que posee un orbital externo libre.

3. Las soluciones tampón regulan el pH de la célula
Los tampones son sistemas acuosos que tienden a amortiguar los cambios que se producen en el
pH, cuando se añaden pequeñas cantidades de ácido o de base. Estos sistemas están construidos
por un acido débil y su base conjugada, o al contrario, entones el sistema tiene una gran capacidad
de H+ podrá ser absorbida por la base conjugada, y si se incrementa la concentración de OH, será
el acido débil del sistema tampón quien seda un protón al medio que neutralice el ión hidroxilo.