Panorama de l'Information Scientifique et Technique pour le doctorant

Panorama de l'Information Scientifique et
Technique pour le doctorant

L'intégrale
©Club photo et Maxime Storn

(épisode 1 + épisode 2)
Céline Andrieu, Alain Marois – Bibliothèque Michel Serres
Philippe Eyraud – Bibliothèque du LMFA

Episode 1



La lourde tâche du doctorant...
Participer à des
congrès
Rédiger sa thèse

Assister à des
séminaires

Valoriser son travail

Préparer sa vie professionnelle

16/05/2011

Rédiger et publier
des articles

Se faire connaître, entrer dans un
réseau

Formation Doctorants Episode 1 - Bibliothèque 16/05/11

2

Mais il n'est pas si seul !
Équipe de recherche
Collège des pairs
(évaluation)

Autres doctorants

Assistance de la bibliothèque,
d'un documentaliste
Outils à sa disposition

16/05/2011


3

Vraiment pas seul...
Vague connaissance croisée sur un
autre campus du PRES
Équipe de recherche
Collège des pairs
(évaluation)
Geekette sympa rencontrée
à la machine à café
Autres doctorants

Assistance de la bibliothèque,
d'un documentaliste
Outils à sa disposition

« Le type là-bas qui connaît LaTeX »

16/05/2011

La secrétaire du Pr. X,
« super calée en Word »


4

Objectifs de cette formation
Episode 1
●

Se situer dans l'environnement de l'IST

●

Optimiser l'utilisation des sources d'information

scientifiques et techniques
●

Comprendre l'évaluation de l'information scientifique

●

Mettre en place une stratégie de veille

16/05/2011


5

Objectifs de cette formation
Episode 2 :
●

Organiser son travail bibliographique

●

Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans

sa production, en fonction du logiciel choisi
●

Publier et archiver sa production

16/05/2011


6


16/05/2011


7

Qu'est-ce que l'IST ?
« L'information scientifique et technique (IST)
regroupe l'ensemble des informations produites par la
recherche et nécessaires à l'activité scientifique comme
à l'industrie ». (Ministère de l'Enseignement supérieur)
L'IST couvre tous les secteurs scientifiques et
techniques et se présente sous de multiples formes.

16/05/2011


8

« Information Scientifique et Technique »
articles, revues
et ouvrages scientifiques
spécifications techniques décrivant
des processus de fabrication

notices de brevet
BDD bibliographiques
littérature grise :
thèses, pre-prints,
rapports, actes de
congrès...

IST

normes
banques de données brutes

archives ouvertes et
entrepôts de données
accessibles sur internet

16/05/2011

documentation technique
accompagnant les produits

portails


9

Positionnement du doctorant

Analyser le sujet
Rechercher et
évaluer
l'information

Mettre en place
une stratégie de
veille

Gérer l'information

Produire l'IST
Publier
Archiver

=> penser « flux »
16/05/2011


10

Optimiser l'utilisation
des sources d'information

16/05/2011


11

1. Le kit de survie
Les Techniques de l'ingénieur
Les catalogues de
bibliothèques
Les moteurs de recherche
scientifiques sur le web

16/05/2011


12

Choisir des sources d'informations
http://bibli.ec-lyon.fr/ressourcesElec/ressourcesElec.php

Les sources d'info les plus pertinentes

Accès aux sources
d'informations depuis le
site de la bibliothèque

16/05/2011


13

Les Techniques de l’Ingénieur : recherche avancée
Veille technologique et actualités

Formulaire de recherche avancée

Encyclopédie spécialisée en sciences
et techniques

16/05/2011


14

Les Techniques de l’Ingénieur : résultats

16/05/2011


15

Les Techniques de l’Ingénieur : article

Article au
format PDF

Accédez à des données et services
complémentaires en vous identifiant
: biblio; signets,...

16/05/2011


16

Les Techniques de l’Ingénieur : traducteur multilingue
http://www.techniques-ingenieur.fr/lexique.html

Champ de
recherche

16/05/2011


17

Les catalogues
des bibliothèques localisées sur le campus ECL

des bibliothèques de l'enseignement
supérieur et de la recherche en France :
universités, grandes écoles...

de plus de 70 000 bibliothèques
dans le monde
Pour trouver des livres, revues, thèses...
16/05/2011


18

Le catalogue des bibliothèques du campus ECL :
Bibliothèque Michel Serres et bibliothèques de laboratoires

http://doc.ec-lyon.fr

Un « catalogue », cela permet de
trouver une référence (ex : le titre
d'un livre) et d'accéder au
document (ex : le livre papier ou
électronique)

16/05/2011


19

Catalogue des bibliothèques du campus ECL : recherche experte
1

Localisation des exemplaires sur le campus

2

Pole + Cote => vous
trouvez le document

16/05/2011


20

Le SUDOC, Système universitaire de documentation
La recherche avancée : évitez le
bruit informationnel (les « bons »
résultats noyés dans la masse)

http://www.sudoc.abes.fr

Trouvez tout ce que peuvent
avoir les différentes
bibliothèques participantes

Choisir un type de document

16/05/2011


21

Le SUDOC : résultats et localisation
Types de documents

1

Trouver ce livre en
France

3

2
Localisaction des
exemplaires sur la France

Vous pouvez emprunter
gratuitement dans les
principales BU de Lyon
(Insa, Lyon1,2,3, ENS,...);
sinon, pensez au
Prêt Entre Bibliothèques
(PEB)
16/05/2011


22

WorldCat
http://www.worldcat.org/

16/05/2011


23

Focus : rechercher et consulter
des thèses imprimées ou électroniques

16/05/2011


24

Comment consulter une thèse
Les thèses soutenues en France (recensées dans le
SUDOC) peuvent être consultées :
●

sous forme imprimée dans la bibliothèque de

l’établissement de soutenance (possibilité de faire un PEB)
●

sous forme électronique sur le site des bibliothèques ou

sur TEL-Thèses en ligne

16/05/2011


25

Coming soon...

16/05/2011


26

STAR

16/05/2011

Application qui permet de traiter
et diffuser les thèses soutenues
en France


27

http://www.dart-europe.eu

Portail européen des thèses électroniques,
dont les thèses françaises déposées dans
STAR depuis 2009

16/05/2011


28

Trouver une thèse dans le SUDOC : recherche

Choix du type de document

16/05/2011


29

Trouver une thèse dans le SUDOC : résultats
1
Thèse électronique
Thèse imprimée

2

3

Lien vers la thèse
électronique

16/05/2011


30

Consulter une thèse électronique
sur TEL – Thèses en ligne
http://tel.archives-ouvertes.fr/

Sous-ensemble de
l'archive ouverte française
HAL : serveur d'autoarchivage
● Dépôt des thèses
françaises
● Objectif : rendre
rapidement et gratuitement
disponibles des documents
scientifiques
●

Attention : dépôt volontaire par
le doctorant (ou via le circuit de
la thèse électronique pour
l'ECL par exemple)...

...donc si toutes les thèses
de TEL sont signalées dans
le Sudoc, tout ce qui est dans
le Sudoc n'est pas dans
TEL !

16/05/2011


31

Les moteurs de recherche scientifiques

Google ...2004

Elsevier ...2001

16/05/2011


32

Des outils parmi d'autres....

16/05/2011


33

« Scientific information only » ?

16/05/2011


34

Que peut-on y trouver ?
Sites « de qualité » indexés

Silos de données indexés

Précisions sur les sources

16/05/2011


35

Gérer la multiplicité des sources

16/05/2011


36

Trier par type de fichiers

Contrôle des sources

Disciplines (algorithme)

16/05/2011


37

16/05/2011


38

16/05/2011


39

« Un jeune homme brillant,
mais inconstant... »

16/05/2011


40

Brillant !
●

Simplicité + rapidité

●

Facilite l'accès au texte intégral

●

Index de citations => ranking, « bibliométrie »

●

Large couverture

●

Gratuité...

16/05/2011


41

Inconstant...
●

Nombre de résultats variables

●

Opacité (Sources ? Couverture ?? Algorithme ???)

●

Affiliations ?

●

Métadonnées (auteurs,...) laissant à désirer

●

Peu d'options avancées

16/05/2011


42

16/05/2011


43

16/05/2011


44

16/05/2011


45

16/05/2011


46

Pensez-y : les opérateurs de GS

16/05/2011


47

Résultats Google
Scholar via la
« recherche
universelle » Google

16/05/2011


48

Focus : Archives ouvertes
( HyperArticles en Ligne, arXiv.org)

16/05/2011


49

HAL permet un dépôt et un
signalement rapide des articles,
colloques,...par les chercheurs
eux-mêmes

16/05/2011


50

HAL est une « archive ouverte »
incarnant en France le mouvement dit
du libre accès à l'information
scientifique (Open Access). Généralise
le modèle historique qu'est arXiv.org

16/05/2011


51

2. Approfondir sa recherche avec
des bases de données bibliographiques

des portails d'accès aux revues
scientifiques : accès ECL et CNRS
Pour trouver des articles, pre-prints, actes de congrès...

16/05/2011


52

Les bases de données bibliographiques

16/05/2011


53

Scopus
●

BDD pluridisciplinaire créée en 2004 par Elsevier

●

Donne accès à de nombreuses références scientifiques

issues de :
●

revues à comité de lecture

●

sites internet de qualité (< Scirus)

●

bases de brevets

16/05/2011


54

Outil similaire...
●

au Web of Science, mais couverture + large (+ de 18000

revues)
●

à Google Scholar, mais + performant (bonne gestion des

auteurs, citation tracking…)
●

Outre la recherche par sujet, elle fournit des indicateurs

pour évaluer la production scientifique d'un auteur ou
d'une institution, une revue (citations depuis 1996)
16/05/2011


55

Scopus : recherche de document

Combiner ses mots-clés
Choix du champ
d’interrogation
Appliquer des limites

16/05/2011


56

Scopus : résultats
Résultats dans Scopus
Résultats sur le web,
dans les brevets...

Affiner ses résultats

Accès direct à l'article*

* le lien pointe vers l'article sur le site
web de la revue; l'accès n'est effectif
que si l'ECL est abonnée à la revue
via la bibliothèque
16/05/2011


57

Télécharger le
PDF

Scopus : notice détaillée
Références de l'article

Les auteurs et leurs affiliations

16/05/2011


58

Scopus : recherche par auteur

Outil conseillé pour retrouver
toutes les publies d'un auteur ou
éviter les homonymes

16/05/2011


59


Accès à la fiche de l'auteur

Accès à ses publications

16/05/2011


60

Accès à ses publications

16/05/2011


61

Web of Science : accès CNRS

Le CNRS propose des
« portails » thématiques;
au sein de ces portails
vous pouvez accéder à
de nombreuses bases

Accès au Web of Science
16/05/2011


62

Web of Science : recherche de document

Combiner ses mots-clés
Choix du champ
d’interrogation

Appliquer des limites

16/05/2011


63

Web of Science : résultats
Télécharger le PDF

Les auteurs
Références de l'article

16/05/2011


64

Les portails d'accès
aux revues scientifiques

16/05/2011


65

Depuis le site de la bibliothèque
Accès via la rubrique
« Documentation
électronique »

Accès payé par l'ECL

Editeurs de revues commerciales

Revues en libre accès
(Open access journals)
16/05/2011


66

Les portails d'information du CNRS

Accès par mot de passe, propre à chaque laboratoire CNRS
demandant l’accès à ce service. Accès nomade

16/05/2011


67

Exemple : le portail BiblioST2I

Editeurs de revues commerciales

16/05/2011


68

Comparaison accès ECL / BiblioST2I
ECL

BiblioST2I

Web of Science

1991-2011
(abonnement interrompu en 2009)
+ Medline

1899-2011
+ Current Contents
+ Medline
+ Journal Citation Report
+ Essential Science Indicator

Science Direct (Elsevier)

1995-2011

Origines-2011 pour de
nombreux titres

Springerlink

1997-2011

Origines-2011 pour de
nombreux titres

Springer e-books

Lecture Notes in Computer Science
(LNCS)

Collection chimie/sciences de
l’ingénieur + LNCS

16/05/2011


69

Comprendre l'évaluation de
l'information scientifique :
de l'évaluation qualitative à l'évaluation
quantitative de la recherche

16/05/2011


70

Critères d'analyse d’un article scientifique
●

Auteurs

●

Institution (affiliation)

●

Notoriété de la revue (Facteur d'impact)

●

Date de publication

●

Structuration du contenu (démarche scientifique)

●

Bibliographie…
→ Grille d'analyse d'un article scientifique

16/05/2011


71

L'évaluation quantitative de la production
scientifique : indicateurs
●

Pour un auteur : nombre et types de documents

produits, nombre de citations de sa production, h index...
●

Pour un article : nombre de fois où il est cité par d'autres

articles, la revue dans laquelle il est publié (facteur
d'impact)

16/05/2011


72

Outils pour évaluer la production scientifique
●

Google Scholar : nombre de citations d'un article

●

Scopus : Author Evaluator (nombre de documents

produits, de citations et h index) et View citation overview,
Analytics (comparaison entre revues)...
●

Web of Science : Citation Map (pour un document),

Citation Report (pour un auteur), h index
●

Journal Citation Reports
16/05/2011


73

Google Scholar : citations

Nombre de citations par document

16/05/2011


74

Scopus : fiche d'un auteur

Accès aux types de documents produits, aux
citations et au h index

Accès aux documents citant la production de cet
auteur

16/05/2011


75

Attention : qu'évalue-t-on exactement ?

En réalité seulement 39 articles sur 101
documents produits

16/05/2011


76

Les biais des indicateurs...

On peut enlever les auto-citations

Et cela impacte le h index

16/05/2011


77

Mise en garde par Scopus...

16/05/2011


78

Scopus : recherche par affiliation
1

2

Accès au nombre de documents et
auteurs appartenant à cette affiliation

16/05/2011


79

Scopus : recherche par affiliation

16/05/2011


80

Scopus : Analytics
Permet de comparer les citations de plusieurs revues entre elles

16/05/2011


81

Web of Science : Citation Map
1

2

Lancer Citation Map à partir d'une publication

16/05/2011


82

Web of Science : Citation Map
1
Choisir le type de
graphique qu'on souhaite
afficher

2

16/05/2011


83

Web of Science : recherche par auteur
1

2

16/05/2011

Nombre de publications de
l'auteur...indexées (présentes) dans
la base du WoS


84

Web of Science : Citation Report

Accéder au Citation
Report

16/05/2011


85

Web of Science : Citation Report
Nombre de citations,
d'articles cités, h
index...
Possibilité d'enlever
les auto-citations

h index

16/05/2011


86

Les limites du h index
●

Le h index n’a de sens que si l’on compare des auteurs

dans une même discipline et d'une même tranche d'âge
●

Cf Hirsch, J. E. (2005). An index to quantify an

individual's scientific research output. Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States of
America, 102(46), 16569-16572.

16/05/2011


87

Journal Citation Reports :
Facteur d'impact d'une revue

L’édition Science couvre
plus de 7200 revues dans
171 disciplines

16/05/2011


88

1

2
Choisir une catégorie de
sujet

Puis classer par facteur
d'impact

16/05/2011


89


Comment se situe la
revue par rapport aux
autres revues, selon son
facteur d'impact

16/05/2011


90

1

Possibilité d'enlever les
auto-citations

2

16/05/2011

Impact des auto-citations


91

1

Accéder au JCR à
partir du
Web of Science

2
Facteur d'impact
sur 5 ans

16/05/2011


92

Les limites du facteur d'impact
●

Il reflète la situation des revues des 2 années

précédentes (et non la situation actuelle)
●

Peu d’articles d’une revue donnée sont fortement cités,

publier dans une revue à fort facteur d’impact n’assure
donc pas forcément que l’article sera lu
●

Comparer des facteurs d’impact dans une même

discipline
16/05/2011


93


16/05/2011


94

La veille : définition
« Activité continue et en grande partie itérative visant à
une
surveillance
active
de
l'environnement
technologique, commercial, etc., pour en anticiper les
évolutions ». (Norme AFNOR XP X50-053, avril 1998)
Elle nécessite la mise en place d’une stratégie

16/05/2011


95

La veille : objectifs
●

Faciliter l'identification des ressources pertinentes

●

Maintenir un flux régulier d’informations dans son

domaine / actualiser ses informations
●

Déceler les évolutions du domaine étudié

●

Continuer à être informé de nouvelles parutions

pertinentes après une recherche documentaire
16/05/2011


96

La veille : objectifs

Gagner
du
temps !

●

Faciliter l'identification des ressources pertinentes

●

Maintenir un flux régulier d’informations dans son

domaine / actualiser ses informations
●

Déceler les évolutions du domaine étudié

●

Continuer à être informé de nouvelles parutions

pertinentes après une recherche documentaire
16/05/2011


97

La veille : les étapes...
récolte
ciblage

VEILLE

analyse
diffusion

16/05/2011


98

...pour une approche stratégique
●

Le ciblage : définir les thèmes étudiés et les sources à utiliser

●

La récolte des informations : utiliser les bons outils

●

L’analyse des données : collecter uniquement ce qui est utile

en excluant les données non fiables et non pertinentes
●

La diffusion des résultats de la veille pour valoriser (on la

gestion / conservation / partage)

16/05/2011


99

La veille : accès à l’information
Deux méthodes :
●

PULL : l’usager va chercher l’information (recherche

précise mais qui demande du temps)
→ historiques de recherche, signets web, consultation de
sommaires de revues, personnes ressources...
●

PUSH : l’information vient à l’usager (gain de temps

mais risque de surabondance de l'information)
→ profils et alertes par e-mail, fils rss...
16/05/2011


100

La méthode PUSH
Elle apporte de manière directe et automatique des informations en
fonction de critères préétablis. Différents outils peuvent être utilisés :
●

Bulletins d’informations, newsletters électroniques

●

Listes de discussion

●

Fils d’informations grâce aux flux RSS rassemblés dans des agrégateurs

(Netvibes, Google Reader…)
●

Services d’alertes par envoi de courriels (Google Alerts)

●

Outils de monitoring qui aspirent, à intervalles définis, les sites web

sélectionnés et signalent les changements intervenus (Wysigot Light,
WebSite-Watcher, Update Scanner....)
16/05/2011


101

Veille et flux RSS : exemple sur le web
Fils RSS : flux structurés de contenus en
provenance de sites Internet, incluant les titres
des articles et des liens vers ces articles à
consulter en ligne.

Certains sites proposent plusieurs flux

16/05/2011


102

Veille et flux RSS : exemple sur le web
Pour lire un flux RSS facilement, utiliser
un...logiciel de lecture de flux RSS

Les navigateurs modernes sont
compatibles avec les flux RSS. Ce peut
être un premier choix

Pour plus d'informations sur l'utilisation des flux RSS
=> « Optimiser sa veille avec les flux RSS »
http://bibli.ec-lyon.fr/documents/RSS_2010-2.pdf
16/05/2011


103

Veille avec une BDD biblio : Scopus
Recevoir les derniers articles correspondant à votre
recherche : sauvegarder une requête et créer une
alerte par e-mail ou par flux RSS
●

Etre prévenu d'une nouvelle citation d'un article : créer
une alerte sur un document cité
●

Connaître les nouvelles publications d’un auteur ou des
publications citant cet auteur : créer une alerte sur un
auteur
●

Suivre l’actualité d’une institution : créer une alerte sur
une institution
●

16/05/2011


104

104

Votre veille sous Scopus : 4 méthodes

requête

document

Scopus

institution

auteur

16/05/2011


105

105

Scopus : créer son compte
1

Pour créer son compte

2

16/05/2011


106

106

Scopus : créer une alerte sur une requête
Sauvegarder une
requête dans « My
settings »

Créer une alerte
par e-mail sur la
requête

Créer une alerte
grâce au fil RSS

16/05/2011


107

107

Scopus : créer une alerte sur une citation
Créer une alerte
par e-mail sur un
document cité

16/05/2011


Créer une alerte
grâce au fil RSS

108

108

Scopus : créer une alerte sur un auteur

Créer une alerte par email sur une nouvelle
publication de cet auteur

Créer une alerte
grâce au fil RSS

Créer une alerte par e-mail
sur une nouvelle citation
d'une publication de cet
auteur

16/05/2011


109

109

Scopus : créer une alerte sur une
institution
Créer une alerte par email sur une nouvelle
publication rattachée à
cette institution

16/05/2011

Créer une alerte
grâce au fil RSS


110

110

Scopus : gérer ses alertes
dans « My alerts »

16/05/2011


111

111

Scopus : « My settings »

Alertes
sauvegardées

Requêtes
sauvegardées

Listes
bibliographiques
sauvegardées

16/05/2011


112

112

En attendant l'épisode 2...
Retrouvez nos supports de formation thématiques :
http://bibli.ec-lyon.fr/Formation/consulter_supports.php?rb=supports

16/05/2011


113

Questions ?
Céline Andrieu 04.72.18.67.44 celine.andrieu@ec-lyon.fr
Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr
Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 philippe.eyraud@ec-lyon.fr

16/05/2011


114

Episode 2



Rappels...
Episode 1
●


●

Optimiser l'utilisation des sources d'information

●

Comprendre l'évaluation de l'information scientifique

●


2

Ce qu'on vous propose aujourd'hui
Episode 2 :
●

Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans

sa production, en fonction du logiciel choisi :
●

●

●

Zotero
Mendeley


3

Gérer ses références bibliographiques
et les utiliser dans sa production


4

Trop de références bibliographiques

sur une idée originale de Valentin Vivier


5

Gérer sa bibliographie
S'organiser
● Capitaliser
● Privilégier le fond sur la forme
● Partager des références, collaborer
● Découvrir de nouveaux travaux ?
●


6

Des outils dédiés


7

Besoins* classiques...et émergents
*données 06/2010

sur une idée originale de Martin Fenner


8

Zotero


9

Zotero
Extension du navigateur Firefox + services en
ligne (http://www.zotero.org)
● = > Windows + Mac + Linux
● Gratuit...
● ...comptes « premium » si besoin
● Opensource
● Institutions + vaste communauté
● Nombreux styles bibliographiques
● Évolution rapide
●


10

Zotero : l'appui institutionnel

+


11

Un couteau suisse


12

Installation de Zotero


13


14


15


16

Installation : autoriser et redémarrer Firefox
1
Comme toute extension Firefox, vous
devez redémarrer votre navigateur
pour finaliser l'installation

Cliquer sur Installer...

2

3

Une fois Firefox redémarré, Zotero
apparaît dans la liste des modules
complémentaires


17

Il vous est proposé de vous créer un
compte sur le site zotero.org. Ce n'est
pas obligatoire...

...mais cela vous permettra d'utiliser les
fonctionnalités de synchronisation et
de collaboration de l'outil


18

Utilisation de Zotero


19

La barre d'outils

La recherche

Votre bibliothèque et
vos marqueurs

Détail d'une référence


20

Zotero :: Collecter des références


21

Zotero :: Organiser sa bibliothèque


22

Zotero :: Citer des références


23

Zotero :: Exporter pour BibTeX


24

« Avant toute chose : avoir du style »

Répertoire public des styles zotero.
Respecte le standards CSL1.0.

Les fichiers de styles sont chargés
automatiquement (« Install »)


25

Zotero :: Synchroniser et collaborer


26

La confidentialité en question

« Tout ou rien » : vous ne pourrez pas
(pour l'instant) restreindre la visibilité de
certaines collections; idem pour les
notes


27

Les groupes Zotero
3 types de groupes

Les groupes permettent de partager
des notices, notes et fichiers entre
membre en maitrisant finement la
confidentialité

Private Groups : pas de profil public; page du
groupe visible pour membres invités; invisible
dans les recherche
Public, Closed Membership : pqge publique
possible; sur invitation ou validation d'une
demandre; collections visible ou pas au sein de
la bibliothèque
Public, Open Membership : adhésion libre;
visibilité; pas de stockage de fichiers


28

L'avenir de Zotero


29

Zotero : aide, information
Blog de Zotero

Zotero francophone, communauté fr
autour de Zotero

Tutoriels vidéo en ligne
Forums actifs sur Zotero.org


30

Mendeley


31

Mendeley
Logiciel à installer + service en ligne
(http://www.mendeley.com)
● Windows + Mac + Linux
● Modèle de Last.fm (partage de musique)
● Version beta, gratuit, mais...
●...business model en évolution, mais...
●... « what is free now will remain free »
● Société basée à Londres
●


32

Mendeley


33

Installation de Mendeley


34

Téléchargement : option 1

Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte


35

Téléchargement : option 2

Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori

Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes


36

Installation : les plugins Word et OpenOffice
1

2

4

3

Compatibilité OpenOffice

Compatibilité Word 2003 - 2007


37

Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
Barre d'outils

Moteur de recherche

Collections, collections
partagées, corbeille

Liste des références

Filtres (auteurs, journaux,
tag, mots clés auteur)
Détails, tag et annotations,
références citées


38

Créer sa bibliothèque de références


39

Ajouter des références : via Mendeley Desktop

Différentes stratégies :
●

Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents

●

« Watch a folder », pour l'import automatique de PDF

●

Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.

Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...

...et Mendeley extraira les descriptions du document
PDF automatiquement


40

Ajouter des références : utiliser l'import web
1

Un simple lien placé dans la barre d'adresse
permet d'importer directement des résultats
de recherche à partir des sites compatibles

2

Choisir les références dans la fenêtre
dédiée, annoter, ajouter des tag


41

Import web : installation et compatibilité
http://www.mendeley.com/import

Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...

Les principales sources d'information scientifique


42

Synchronisation de sa bibliothèque de
références
Synchronisez votre bibliothèque Mendeley
Dekstop avec votre compte en ligne

Gestion et édition en ligne de vos références


43

Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
1
Indiquez le dossier à importer contenant les
PDF

3
2

Mendeley va chercher les informations décrivant
les documents dans les bases de données
d'information scientifique

L'importation se déroule automatiquement et les références
correspondant aux documents PDF apparaissent


44

Si vous venez de EndNote
1
Sélectionner les références à exporter

Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)

2

Dans Mendeley, choisir le format d'import
RIS ou EndNote Xml suivant le format
d'export EndNote

De la même manière, Mendeley peut
importer des listes de références aux
formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...


45

Gérer sa bibliothèque de références


46

Des fonctions de gestion simples et utiles
Collections créées par défaut :
●Toutes les références
●Ajouts récents
●Mes favoris
●Références à vérifier
●Mes publications
●Publications non classées

Triez rapidement vos listes en
cliquant sur les entêtes de colonne

Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture
Créez vos propres collections

Les références peuvent être marquées
comme « à lire », « lues », « favorites »
Filtrez vos listes de références de façon aisée


47

Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
Recherche dans les références et
les PDF de toutes les collections

Suggestion de termes au
court de la frappe

Mise à jour de la liste de
résultats au cour de la frappe

Mise en contexte et surlignage
des termes recherchés


48

Utilisation avancée du moteur de recherche
champs:terme à rechercher

Exemples :
● author:harnad
● keyword:Bacteria
● publication:nature
● tag:tools
● title:« open access »


49

PDF : lecteur intégré et recherche de mots-clés
Outils d'exploitation avancée : notes,
surlignage manuel, lecture plein écran, etc.

Ouverture des PDF
dans des onglet dédiés

Surlignage du terme recherché dans le PDF


50

PDF : surlignez et annotez vos documents

Notes générales

Annotation (avec auteur et date)

Listes des annotations avec leurs
liens pour une navigation aisée
Passage surligné manuellement


51

Classez et renommez automatiquement vos fichiers
Tools > Option > File Organizer
L'outil de gestion des fichiers et ses options

Classement et nommage paramétrables


52

Classez et renommez automatiquement vos fichiers

PDF (et autres fichiers) joints renommés

Fichiers organisés automatiquement en arborescence


53

Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation des
noms de journaux, auteurs, tag, etc.

2

Mendeley modifie automatiquement
les références en conséquence

1

Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les
unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs

Passage surligné manuellement


54

Citer en utilisant ses références


55

Citer dans Word et OpenOffice 1/2
Cliquer sur « Insert Citation » dans
la barre d'outil Mendeley de Word

2

1
Placer son curseur à l'emplacement de
l'appel de citation dans votre texte

3

Dans Mendeley, choisir la référence à citer


56

Citer dans Word et OpenOffice 2/2
Cliquer sur « Send Citation to Word »

4

5
L'appel de citation est intégré au format
choisi à l'emplacement du curseur


57

Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
Cliquer sur « insert Bibliography »

2

Choisir un style bibliographique

Finaliser son texte avec
tous les appels de citation

Vous pouvez changer le style :
le document se met à jour

1
Positionner son curseur à l'endroit
où doit figurer la bibliographie

3
La bibliographie est générée automatiquement


58

Produire une simple liste de références formatées
Sélectionnez des références

La liste est au format sélectionné

Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)

Cela fonctionne aussi par copier-coller


59

Un vaste choix de styles bibliographiques
Ooo : « Choose Citation Style »

Word : « Other citations from Mendeley »

Recherchez et sélectionnez un style


60

Utiliser LaTeX / BibTeX : options de synchronisation de
la bibliothèque de références
Tools > Options > BibTeX

Prise en compte de caractères spéciaux

Mise à jour automatique du fichier .bib

Clés BibTeX éditables si besoin
référence par référence

Un ou plusieurs fichiers. On peut
imaginer le mettre sur un dossier
partagé...


61

Partager, collaborer, s'intégrer à une
communauté en gérant son identité
numérique


62

Rendre une collection publique
Les critères de publication des collections sont paramétrables
pour chacune d'entre elles indépendamment des autres

Rendez vos collections
publiques via « Edit Settings »

D'autres usagers pourront s'abonner
à vos collections publiques. Vos
modifications seront répercutées
dans les Mendeley Desktop des
autres membres abonnées. Les
membres abonnées à une collection
sont visibles, ainsi que l'auteur d'une
collection

63

Créer une collection partagée pour collaborer

Une collection partagée entre membres n'est
visible uniquement que par ses membres.
Vous pouvez inviter vos contacts à partager
une collection que vous avez créée.
Les références sont alors visibles et
modifiables par tous les membres partageant
la collection.
Les fichiers PDF peuvent être mis en commun
et annotés collaborativement.


64

Compléter son profil et sa liste de publications :
l'identité numérique du chercheur
Liste des publications du
chercheur, mise à jour via une
collection Mendeley

CV du chercheur
Statistiques sur ce
chercheur

Contacts du chercheur
Contacter ce chercheur
Collections publiques
du chercheur


65

Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?

“

We define social network sites as webbased services that allow individuals to
(1) construct a public or semi-public
profile within a bounded system, (2)
articulate a list of other users with
whom they share a connection, and (3)
view and traverse their list of
connections and those made by others
within the system.

”

Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship.
Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from
world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.


66

Paramétrer la confidentialité de son profil

Se tenir informé

Plusieurs niveaux de confidentialité


67

Valoriser son travail bibliographique et son expertise

Créer par simple copier-coller
une liste de publication mise à
jour automatiquement

Inclure un bouton vers son profil
dans votre signature de courriel
ou sur son blog de chercheur


68

Trouver de l'aide


69

Mendeley : participer, suivre l'évolution
Suggérez

Suivre les mises à jour

Votez

Etat

Commentez


70

Statistiques et sérendipité
Données globales

Articles les plus lus

Données par disciplines

>

Auteurs les plus lus


71

JabRef


72

Installation
Nécessité d'avoir le logiciel
Java installé

Choisir son fichier
d'installation

1

2

Télécharger la dernière
version stable


73

Langue d'utilisation
Options → Preferences

Profitez du français !!


74

Ouvrir un fichier .bib

Intégrer une base bibtex


75

Visualiser une base
Onglet « bases »

Fichier source bibtex

Visualisation de la notice


76

Créer une nouvelle entrée manuellement

Ajout d'une notice à la
main

Format de notice selon
type de document


77

Créer une nouvelle entrée manuellement

Baguette magique :
création automatique de la
clé bibtex


78

1

« Recherche internet »
2

Interrogation de bases sur
internet...depuis JabRef

Rapatriement
automatique des notices


79

Finalement, quel outil choisir ?
Voir Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010. Principaux logiciels de gestion
bibliographiques utilisés au Cemagref : récapitulatif des avantages et
inconvénients. Available at: http://tinyurl.com/RefMagSoftCompareCadiou2010
[Consulté mai15, 2011].


80

JabRef
Les «+»
● compatible avec Windows, Linux et Mac
● gestion des fichiers joints
● création de groupes de références
● accès aux bases par onglets
Les « - »
● encore quelques soucis avec Open Office
● pas de partage de données
● l’interface reste moins intuitive que celle des autres logiciels
● pas de gestion des doublons
● importation irrégulière à cause de la répartition des champs en
onglets (le contenu d’un champ vide peut se retrouver dans BibTeX)
Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010


81

Zotero
Les «+»
● La capture de pages web très facile, le téléchargement de PDF et la
compatibilité avec de nombreux catalogues et bases de données
● Outil gratuit et open source
● Requêtes dynamiques
● Chronologie, rapport, liste biblio : faciles à éditer
● Accès distant : synchronisation possible d’une base sur un serveur
de Zotero ou sur un serveur interne WebDav
Les « - »
● L’interface pourrait être améliorée
● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte gratuit sur serveur
● On ne peut gérer qu’une bibliothèque et on ne peut pas
synchroniser ou partager une sous-collection
● Liens avec traitement de texte pas toujours très fiables


82

Mendeley
Les «+»
● Interface claire et intuitive
● Le collaboratif avec «Shared Collection»: partage d’une sélection de
références et de leurs documents attachés
● Tags personnalisés
● Gestion des PDF performante (moteur de recherche, annotations...)
● Consultation, édition, et alimentation en ligne de la base
● Réseau social, partage avec la communauté de chercheurs
Les « - »
● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte
● Pas plus de 10 participants par "SharedCollection"
● Pas de détection des doublons
● Pas de gestion et création de styles élaborée
● Les nouvelles fonctionnalités ou capacités de stockage sont payantes


83



84

Droit d'auteur ?
●

Vos droits par rapport à votre éditeur et vos lecteurs

●

Vos devoirs envers les auteurs que vous citez

●

Protection des œuvres littéraires et artistiques, sur tout

support (œuvre originale et mise en forme pour être
communiquée)
●

Droits moraux / Droits patrimoniaux


85

Droits moraux
●

Perpétuels, transmissibles aux héritiers

●

Droit de paternité : revendiquer la paternité de l’œuvre

et exiger la mention de son nom lors de l'exploitation
(citation)
●

Droit de divulgation, de présentation au public et au

respect de l’œuvre


86

Droits patrimoniaux
●

Droit de reproduction : autoriser ou non la

reproduction d'une œuvre, sa traduction, son adaptation
●

En contrôler sa distribution, importation, reproduction ,

citation, prêt.
●

Droit de représentation

●

Rémunération de l'auteur


87

Droits patrimoniaux
●

L'auteur peut par contrat céder ses droits patrimoniaux

ou consentir une licence à un tiers (éditeur) :
rémunération de 5 à 15 %
●

Pas de rémunération pour la rédaction d'un article ou

d'un ouvrage collectif (cession gratuite souvent tacite)


88

Alternative : licences Creative Commons
●

Logique inverse : quelques droits réservés (choix de

l'auteur)
●

En accord parfait avec le principe du libre accès

●

Licences perpétuelles (70 ans après la mort de l'auteur)

et irrévocables (on ne peut revenir sur la licence
accordée)

89

Creative Commons 101
●

4 attributs combinables, 6 contrats différents :
●

BY : attribution, paternité (droit moral)

●

NC (Non Commercial) : pas d'utilisation commerciale de
l’œuvre dérivée

●

ND (No Derivate works) : reproduction sans
modification

●

SA (Share Alike) : partage aux conditions identiques

90

Licences Creative Commons


91

Licences Creative Commons


92

La production scientifique de l'ECL

Toutes les informations sur le
dépôt et la rédaction de la thèse


93

Circuit de la thèse

Vade-mecum : circuit de la thèse


94

Valoriser sa production dans une
archive ouverte


95

HAL (Hyper Articles en Ligne)

Se créer des alertes

Les derniers dépôts par discipline


96

HAL (Hyper Articles en Ligne)
« Archive ouverte » pluridisciplinaire destinée au dépôt et à la diffusion de
documents
● => communication scientifique directe
● Donne libre accès à l’information scientifique et technique
●

Types de documents présents dans HAL :
● Publications dans des revues à comité de lecture
● Conférences invitées dans des congrès
● Proceedings à comité de lecture
● Publications dans des revues sans comité
● Communications à des congrès, symposiums
● Séminaires, workshops
● Chapitres dans les ouvrages
● Livres et ouvrages
● Thèses...

97

Pourquoi déposer dans HAL ?
Accessibilité + visibilité
Consultation et dépôt ouverts à tous
Visibilité scientifique internationale :
● du chercheur
● du laboratoire
● de l’établissement ou de l’institution
● des équipes de recherches par rapport aux financeurs (ANR…)
Dépôt fortement préconisé par l’ECL et le CNRS
Simplicité + pérennité
Dépôt simple et rapide : un auteur archive pour les co-auteurs
Possibilité d’ajout de nouvelles versions du document
Pérennité et stabilité des URL (Archivage des données au CINES)

98

Pourquoi déposer dans HAL ?
Intérêt pour la publication
Taux de citation plus élevé pour un article déposé dans une archive
ouverte
Accroissement du facteur d’impact de la revue
Augmentation du cycle de vie de l’article
Extraction et export de bibliographie (rapport d’activité…)
Dépôt simultané dans arXiv
Plagiat / Responsabilité scientifique
Le dépôt permet :
● de garantir la paternité de l’œuvre
● de prendre date
Responsabilisation du déposant (aucun dépôt ne peut être retiré)
Validation de la teneur scientifique et technique du document

99

Les différentes versions d'un document
scientifique
Pre-print : version auteur d'un article avant
évaluation par les pairs (document de travail ou
document soumis pour publication)
●

Post-print : version auteur finale d’un article après
évaluation par les pairs (généralement acceptée pour
publication)
●

Pdf éditeur : version publiée par l'éditeur sur son
site, avec mention du titre du journal
●


100

Politique des éditeurs scientifiques sur le dépôt dans HAL
SHERPA RoMEO


101

Politique des éditeurs scientifiques sur le dépôt dans HAL
SHERPA RoMEO
Des couleurs sont attribuées aux éditeurs selon les droits de dépôts accordés aux auteurs :
● vert : pré-print et post-print ou pdf éditeur
● bleu : post-print ou pdf éditeur
● jaune : pré-print
● blanc : archivage non accepté
Dépôt ?
Editeur

Editeur
Vert
Pré-print

Editeur
Vert
Post-print

Editeur Vert
Pdf éditeur

AIAA
AIP

X
X

X

X*

ASME
Cambridge

Editeur Blanc
Dépôt non
accepté

X
X

Elsevier

X

X**

X

IEEE

X

X

IOP

X

X

Springer

X

X

Wiley

X

X

X
*Sur site perso ou
institutionnel uniquement
** 1 an d’embargo


102

Déposer dans HAL : vérification, authentification,
inscription
Après vérification
● du droit accordé par l'éditeur
● de l'accord des co-auteurs
● que l'article n'est pas déjà déposé
1

Interroger sur les
documents en
texte intégral

2
3


103

Déposer dans HAL : saisie des « métadonnées »


104

Déposer dans HAL : saisie des auteurs


105

Déposer dans HAL : dépôt des fichiers


106

Déposer dans HAL : dépôt des fichiers


107

Déposer dans HAL : confirmation par e-mail après
vérification humaine


108

Questions ?
Céline Andrieu 04.72.18.67.44 celine.andrieu@ec-lyon.fr
Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr
Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 philippe.eyraud@ec-lyon.fr


109

Ressources
●

Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur

le world wide web :
<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.
Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS

●

Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>
●

Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>
●

Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>
●

Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].

Disponible sur le world wide web :
<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>
●

Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-

328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008
Pochet, Bernard. La rédaction d’un article scientifique. Petit guide pratique adapté aux sciences appliquées et sciences de la vie à l’heure

●

du libre accès. [Gembloux (Belgique)]: Les Presses agronomiques de Gembloux, 2009 [cité 24 mai 2011]. Disponible sur le world wide web :
<http://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/24998>.


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