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5 webinaire umt-omacap 2020 -observatoire anomalies genetiques

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mise en place d'un observatoire national des maladies génétiques de l'espèce caprine

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5 webinaire umt-omacap 2020 -observatoire anomalies genetiques

  1. 1. En route pour un observatoire national des anomalies génétiques Illustration avec l’étude des trayons surnuméraires Virginie Clément, idele Isabelle Palhière, INRAE Journée OMACAP – UMT SPR, 15 octobre 2020
  2. 2. Volet 1 : un observatoire national des anomalies génétiques en petits ruminants
  3. 3. Anomalie génétique, kezako ? Michot, P. et al, 2015 Engendre un phénotype déviant par rapport à la population S’accompagne d’une mort précoce (létale ou réforme) Résulte d’une mutation aléatoire de l’ADN Le plus souvent : rare, monogénique, délétère Se transmet d’une génération à une autre
  4. 4. Anomalie génétique, kezako ? Psychologique pour les éleveurs Economique Bien-être animal et santé Mauvaise image auprès du public Discrédit vis à vis d’une race Michot, P. et al, 2015 Engendre un phénotype déviant par rapport à la population S’accompagne d’une mort précoce (létale ou réforme) Résulte d’une mutation aléatoire de l’ADN Le plus souvent : rare, monogénique, délétère Se transmet d’une génération à une autre Conséquences
  5. 5. Anomalie génétique, kezako ? Psychologique pour les éleveurs Economique Bien-être animal et santé Mauvaise image auprès du public Discrédit vis à vis d’une race  Analyses génétiques  Intervention d’acteurs multiples de terrain (déclaration, description clinique, prélèvements) Michot, P. et al, 2015 Engendre un phénotype déviant par rapport à la population S’accompagne d’une mort précoce (létale ou réforme) Résulte d’une mutation aléatoire de l’ADN Le plus souvent : rare, monogénique, délétère Se transmet d’une génération à une autre Conséquences Solution : mettre au point un test ADN de diagnostic permettant de distinguer les porteurs
  6. 6. Un contexte favorable pour créer un observatoire Un observatoire en bovins (ONAB) et en équins (OAE) Des anomalies génétiques en petits ruminants Des équipes de recherche compétentes (INRAE) Des outils génomiques disponibles Une volonté des filières
  7. 7. Un contexte favorable pour créer un observatoire Un observatoire en bovins (ONAB) et en équins (OAE) Des anomalies génétiques en petits ruminants Des équipes de recherche compétentes (INRAE) Des outils génomiques disponibles Une volonté des filières Projet CASDAR « PRESAGE » 2021-2024
  8. 8. 5 groupes d’actions envisagées Action 2 : Evaluation des conditions de création d’un observatoire des anomalies génétiques adapté aux petits ruminants Action 3 : Etude de la faisabilité pratique d’un observatoire à travers l’étude de cas pilotes Action 4 : Déterminisme génétique des anomalies Action 5 : Gestion génétique des anomalies dans les populations Action 1 : Animation du projet et Communication Source : Diane Buisson
  9. 9. Action 1 : Animation du projet et Communication Fiches « anomalies » Protocoles de prélèvement Outils de communication Lien vers outil de déclaration Information et outils à destination des acteurs
  10. 10. Action 2 : Evaluation des conditions de création d’un observatoire des anomalies génétiques adapté aux petits ruminants Inventaires des anomalies existantes (fiches, fréquence apparition) Retour d’expérience -bovins (ONAB) -Mouton Vendéen Cahier des charges pour la création d’un observatoire spécifique des petits ruminants  Groupes de discussion, implication des différents acteurs
  11. 11. Action 3 : Etude de la faisabilité pratique d’un observatoire à travers l’étude de cas pilotes Rédaction d’un questionnaire pour faire remonter les anomalies (ONAB, Ecole Vétérinaire,…)
  12. 12. Action 3 : Etude de la faisabilité pratique d’un observatoire à travers l’étude de cas pilotes Rédaction d’un questionnaire pour faire remonter les anomalies (ONAB, Ecole Vétérinaire,…)
  13. 13. Action 3 : Etude de la faisabilité pratique d’un observatoire à travers l’étude de cas pilotes Rédaction d’un questionnaire pour faire remonter les anomalies (ONAB, Ecole Vétérinaire,…) Application mobile pour la déclaration des anomalies Etude de cas pilotes -ciblés sur des tares connues dans les schémas de sélection -choix des tares et des animaux pour l’analyse génétique
  14. 14. Les tares enregistrées par Capgenes : bilan de la base de données au 28/09/20 Nombre d’animaux porteurs et fréquence d’apparition
  15. 15. Action 4 : Déterminisme génétique des anomalies Approche 1 : du phénotype au génotype Quelle zone du génome est responsable de cette anomalie ? Approche 2 : du génotype au phénotype Des zones du génome en déficit d’homozygotes sont- elles responsables d’anomalies ?
  16. 16. Action 4 : Déterminisme génétique des anomalies Approche 1 : du phénotype au génotype Quelle zone du génome est responsable de cette anomalie ? Approche 2 : du génotype au phénotype Des zones du génome en déficit d’homozygotes sont- elles responsables d’anomalies ?
  17. 17. Action 4 : Déterminisme génétique des anomalies Approche 1 : du phénotype au génotype Quelle zone du génome est responsable de cette anomalie ? Approche 2 : du génotype au phénotype Des zones du génome en déficit d’homozygotes sont- elles responsables d’anomalies ? Détecter les mutations responsables d’anomalies Caractériser finement l’effet des mutations détectées Etablir des tests ADN de diagnostic, à transférer sur le terrain
  18. 18. Action 5 : Gestion génétique des anomalies dans les populations Mmmh… Qu’est-ce qu’on fait maintenant qu’on a détecté l’anomalie ?
  19. 19. Action 5 : Gestion génétique des anomalies dans les populations Comparaison de l’efficacité de différentes méthodes à l’aide de simulations Bilan des différentes méthodes disponibles et de leur pertinence, selon le type d’anomalie Conseils aux maitres d’œuvre des schémas de sélection Inventaire des méthodes de gestion des anomalies génétiques dans les populations animales Mise au point d’une méthode de sélection et d’accouplement des reproducteurs intégrant une anomalie génétique à éliminer (application sur le schéma caprin)
  20. 20. Merci pour votre attention

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