«Amélioration de la santé productive en élevage par la sélection génomique et le conseil» Conférence de presse – 5 juillet 2016

1. « Amélioration de la santé productive en
élevage par la sélection génomique et le
conseil »
Conférence de presse – 5 juillet 2016

2. Qu’est ce que ?
Améliorer la compétitivité de la filière laitière par la Santé animale
> Consommateurs :
• Plus d’aliments santé, « naturels »
• Bien-être animal de + en + important / acte d’achat
• Recherche d’une sécurité alimentaire sans faille
> Transformateurs :
• Mieux répondre aux consommateurs – fidéliser les débouchés
• Différencier la filière laitière française
> Eleveurs :
• Diminuer les coûts de production
• Améliorer le confort de travail et le besoin d’intervention
• Sécuriser la santé du troupeau
• Sélection et Prévention

3. Sélection des meilleurs animaux :
- Génétique (ES et indexeurs)
- Appui technique Conseil en Elevage (ECEL)
Marché (industriel laitier)
AMONT
Production de lait
AVAL
Vente de lait
1er projet réunissant des acteurs de l’ensemble
de la filière bovine laitière !
Une réalisation collective concrète

4. Partenaires professionnels
- Entreprises de sélection
- Entreprises de Conseil en
Elevage
- Industriel laitier
Collaboration scientifique
Unité mixte et technologique gestion
des populations génétique et
génomique (Jouy en Josas – 78)
Une réalisation collective concrète

5. Le Projet
• Projet labellisé par le pôle de Compétitivité
• Obtention d’un financement par le Fonds Unique Interministériel
(Etat et Collectivités territoriales)
Montant total du projet : 4,97 M€ / Aide sollicitée : 1,75 M€

6. Les travaux d’indexation

7. Etude d’association génotypes / phénotypes
1- Identification des animaux
2- Collecte de données 2- Prélèvement de matériel
biologique – extraction ADN
- génotypage
3- Constitution d’une base
de données de phénotypes
3- Constitution d’une base
de données de génotypes
POPULATION DE REFERENCE
GENOTYPES / PHENOTYPES
« Etude d’association
génotypes/phénotypes » = équations
décrivant les relations statistiques entre
génotypes et phénotypes »
INDEXATION GENOMIQUE: estimation du
potentiel génétique d’animaux sans performances

8. Les phénotypes d’intérêt
Races concernées: Holstein, Normande et Pie Rouge.
Phénotypes ayant des répercussions importantes sur le sanitaire, la
santé des troupeaux et leur bien-être, la rentabilité économique des
élevages:
 Note acétonémie
 Données d’observations des lésions des pieds
 Données évènements « santé » (mortalité, métrites, pb
pulmonaires, caillette, fièvre vitulaire,...)

9. 1er caractère : ACETONEMIE

10. Qu’est ce que l’Acétonémie?
 Pathologie métabolique principale des vaches laitières en début de
lactation
 Quels impacts ?
 Diminution de la production laitière (-300 à -500 kg/lact)
 Impact sur la reproduction (retard cyclicité et baisse réussite IA1 jusqu’à
20%)
 Augmentation du risque : rétention placentaire et déplacement de
caillette (x4 à 8)
 Augmentation des mammites cliniques (x3)
 Quelle fréquence ?
• Acétonémie clinique : 3 à 4 % des vaches
• Acétonémie sub-clinique : 12 à 20 % des vaches

11. Acétonémie et GENOSANTE
Objectif: Prévenir et réduire le risque d’acétonémie en élevage
laitier
L’existant:
 Production en routine de dosages des corps cétoniques
 Modèle de calcul d’un indicateur pour les éleveurs (CETODETECT®)
 Valorisation en élevage par un conseil technico-économique adapté déjà
effective et appréciée par les éleveurs
Le projet:
 Mettre en place une évaluation génétique
 Estimer le potentiel d’amélioration par la sélection et le conseil

12. Une évaluation génétique ACETONEMIE fiable
Nombre
d’enregistrements
Nombre de vaches
Normande 451 808 140 015
Holstein/Pie Rouge 2 688 583 806 039
En 2016
Héritabilité :
Population Holstein/Pie Rouge Population Normande
0,10 0,14
 Héritabilité équivalente à celle des cellules
 L’acétonémie est corrélée positivement aux taux et à la fertilité 
l’index acétonémie n’induira pas de contre sélection.

13. Incidence d’acétonémie selon l’index acétonémie
femelle
14% des VL
Très sensibles
50% saines
22% des VL
Sensibles
70% saines
55% des VL
Normaux
83% saines
10% des VL
Résistants
90% saines

14. 0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
-2 à -3 -1 à -2 -1 à - 0,5 0 à -0,5 0 à + 0,5 0,5 à 1 1 à 2 2 à 3
% Vaches en Acétonémie clinique
Incidence d’acétonémie clinique selon l’index
acétonémie femelle - génomique
Très sensibles
5,8% Sensibles
3,2% Normaux
1,9% Résistants
0,8%
 Plus de 15% des femelles avec un index génomique -2 et moins font une
acétonémie clinique contre moins de 1% pour les femelles indexées à +1 et plus
Toutes races

15. Impact économique de l’acétonémie
 Coût moyen de l’acétonémie :
250€/ vache touchée, clinique ou sub-clinique
 Pour un élevage de 100 VL :
24 femelles touchées (seulement 4 « malades »)
Impact : 6000€/an soit 60€/VL présente
= budget Repro/génétique ou Conseil
 Effet de sélection attendu grâce à GENOSANTE :
1ère génération : baisse de 21% : 1200€
2ème génération : baisse / situation initiale de 36% : 2100€ (21€/VL)

16. Fiabilité
- GENOMIQUE:
> Masse de données collectées et utilisées dans l’évaluation:
> CD équivalent à des caractères fonctionnels déjà évalués
(ex: fertilité)
- POLYGENIQUE :
> Ascendance 0,30 (CD actuel obtenu pour les CEL)
> Femelles avec lactation : de 0,50 à 0,60
> Taureaux : >0,90 avec 100 filles
Population
Holstein/Pie Rouge
Population
Normande
Animaux sans performances –
jeunes veaux
0,66 0,58

17. Les avantages
 Pour les Eleveurs:
Animaux sains = Gain économique et confort de travail (moins de pathologies à soigner)
 Pour les Conseillers:
Entreprises de Conseil en Elevage : un index
> qui renforce l’indicateur CETODETECT®
> consolide la valeur du conseil
Entreprises de Sélection : un index
> qui renforce la valeur génétique proposée dans un contexte concurrentiel
> qui renforce la valeur du conseil
 Pour la Filière:
Moins d’utilisation de médicaments, moins d’antibiorésistance, amélioration du bien-être animal
Renforcement potentiel de compétitivité hors prix vs concurrence sur les marchés

18. 2 index dès août 2016
SYNTHESE SANTE
Index de synthèse comme la Morpho.
Composition :
- 30% ACETONEMIE
- 30% REPRO
- 30% SANTE MAMELLE
- 10% LONGEVITE
> une vision globale sur la Santé
> intègrera les prochains critères de santé
ACETONEMIE
Index élémentaire comme la Mammite clinique
> : de Véritables Index
> des Index privés uniquement disponibles auprès des partenaires
Polygénique : adhérents CETODETECT® Génomique : EVOLUTION & partenaires

19. RDV le 11 août avec la diffusion de ces
nouveaux index !

20. Perspectives : 2017
SANTE DES PIEDS
Boiteries => 3ème maladie en élevage laitier par sa fréquence et son
impact économique
 Faible lien avec la morphologie des aplombs
 Prévalence en augmentation
En cours: Action de collecte de données de parage et de génotypage
conjointe EVOLUTION/ECEL
Objectif (/pop de référence)
Phénotypes Génotypes
Population Holstein/Pie Rouge 50 000 12 000
Population Normande 50 000 8 000

21. Conclusion
• Un programme ambitieux, ouvert et collectif, visant à dynamiser
la filière laitière française ainsi que les entreprises du territoire,
• Un projet innovant, cf pas de sélection génétique à ce jour sur les
critères de santé à l’exception des mammites,
• Une motivation et des intérêts communs et partagés entre les
différentes familles professionnelles (Entreprises de Sélection, de
Conseil en Elevage, Industriels,…),
• Une approche originale car globale
... De la collecte de données à une valorisation technico-
économique sur l’ensemble des maillons de la filière bovine laitière.

22. Conclusion
 A court terme:
Eté 2016: 1ers résultats
 A moyen terme:
Amélioration du cheptel et du conseil aux éleveurs,
raisonner les accouplements et sélectionner les ressources
génétiques les plus intéressantes
 Et à plus long terme :
Retombées pour la filière laitière :
o Rentabilité des élevages et renforcement du tissu des
producteurs
o Compétitivité des partenaires