介紹常用資料庫PubMed檢索 (搜尋) 技巧

1. Database Search AND Skills
2014/8/6 (三) 16:00~17:00 @衛生福利部雙和醫院
新光吳火獅紀念醫院 劉人瑋藥師

2. 請造訪
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2
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3. 先告訴您一些觀念
3
} 不是每一個臨床問題都需要這麼辛苦的..
- 背景問題 (background question)
- 疾病/診斷/治療/預後基本資訊，通常不是很詳細或特定
的問題
「什麼是糖尿病? 糖尿病常用治療藥物有哪些?」
- 前景問題 (foreground question)
- 專一且特定的問題，非概括性的問題
我該吃這個藥嗎?「這個藥比現在用的更有效嗎?」

4. 遇到一個臨床問題，您會怎麼做?
4
} 背景問題的解決方法:
- 需求: 快速、正確、方便
- 建議: 用你最習慣的資源
您最常用於解決背景問題的資源是?
資源 優點 缺點
大腦 (本人
的或他人的)
免費、快速 常記錯，有時候不靈光
教科書 具權威性 更新慢、篇幅有限、不易攜帶
線上資料庫 內容廣泛、快速 需連線、付費資料庫價格昂貴

5. } 前景問題的解決方法:
- 速率決定步驟: 對的搜尋策略 (對的資源、對的方法)
遇到一個臨床問題，您會怎麼做?
5
提出問題 關鍵字 搜尋 評讀文獻 證據等級
失敗
>24 hrs
提出問題 搜尋
提出問題 搜尋
提出問題 搜尋 評讀文獻 證據等級關鍵字
提出問題 關鍵字 搜尋 證據等級
~3 hrs
~1 hrs
~30 mins
<15 mins

6. 請務必省思您的問題
6
} 一位55歲長期吸菸男性，父親最近剛發生心肌梗塞，看到
煙盒上大大的警語，開始想要戒菸，一天他來到藥局詢問，
「藥物輔助戒菸有效嗎?」「有一種藥叫做戒必適，是不是
效果更好? 副作用大嗎?」「那一種戒菸方法比較好?」
} 先省思一下遇到的問題
問題 分類 題型
藥物輔助戒菸有效嗎? 背景問題 治療型問題/安慰劑
戒必適效果更好? 副作
用大嗎?
前景問題 治療型問題/其他戒菸
輔助藥物
哪一種戒菸方法比較好? 前景問題 治療型問題/其他戒菸
輔助藥物

7. 背景資訊
7
} 吸菸成癮 (tobacco use disorder ICD-9 305.1) 已經被歸
類為一種物質濫用疾病
} 哪些因素會增加吸菸成癮的風險?
- 青少年時期就開始吸菸 - 家人或朋友吸菸
- 菸品廣告或印刷品 - 電影或電視節目中吸菸鏡頭
} 輔助戒菸的方法:
- 戒菸諮詢 - 行為治療
- 藥物 (尼古丁補充療法、非尼古丁補充療法)
背景資訊的好處 (1) 避免濫無目的亂找 (2) 協助釐清問題
Note

8. 尋找目前最佳的證據
8
} 什麼是最佳的證據?
- 證據強度可能較高的證據: 收納適當研究類型的系統性綜
論 (systematic review)
- 適當研究類型:
- 治療型問題 隨機分派研究 (RCT)
- 診斷型問題 斷面性研究 (cross section study)
- 預後型問題 世代研究 (cohort study)
最佳的證據 不一定是最佳的
證據強度最佳 (strength of evidence) 最新的
研究設計與執行最佳 (study design) 發表在知名期刊上
統計分析最佳 (statistic analysis) 廠商或是專家介紹的
Level of evidence
搜尋

9. 尋找目前最佳的證據
9
} 這麼多種資料庫，如何決定使用那個 (些) 資料庫呢?
- 問題的答案取決於您願意花多少時間解決這個問題
選擇最適當的資源優於大量且效率不佳的搜尋
時間 推薦資料庫
<5分鐘
(第一步)
Summaries (DynaMed、UptoDate、ACP
PIER、clinical evidence)
TRIP database
5分鐘~1小時
(第二步)
PubMed clinical queries、Cochrane
Library、TRIP database
>1小時
(第三步)
PubMed (以MeSH搜尋)、OVID Medline或其
他初級資源資料庫
Note

10. 尋找目前最佳的證據
10
} TRIP database (http://www.tripdatabase.com/)
- 輸入一次關鍵字，可同時檢索各種文章類型 (系統性綜
論、執業指引、病例報告等)、PubMed Clinical Queries
最重要的是免錢的!

11. 檢索效率
11
} 「檢索敏感度」與「檢索精確度」
} 中，與「 dabigatran是否增加心肌梗塞風險?」
相關文獻共100篇，檢索到120篇文獻中，80篇與其相關
- 檢索敏感度 = 80篇相關文獻/100篇總文獻 = 80%
- 檢索精確度 = 80篇相關文獻/120篇檢索總文獻 = 67%
我們希望達到的是「敏感度」與「精確度」之間的平衡
名詞 定義
檢索敏感度 (sensitivity) 檢索到相關的文獻/所有相關的文獻
檢索精確度 (precision) 檢索到相關的文獻/所有檢索到的文獻
Note

12. 檢索效率
12
} 「需讀文獻量 (number needed to read; NNR)」找到一
篇相關文獻所需閱讀篇數
- NNR = 1/0.67 = 1.5篇，每讀3篇會找到2篇相關文獻
} 「檢索平衡 (search balance)」平衡敏感度與精確度
- balance = 0.80 x 0.67 = 0.54

13. 在 裡，我們都熱衷於使用MeSH名詞
但MeSH名詞有「致命」限制您知道嗎?
Question #1
13

14. Tip #1 MeSH名詞
14
} 自然語言 (nature language) 與索引 (index term)
- 以索引搜尋的目的在於增加檢索專一度 (specificity)
常見索引 (index term) 分類系統例如美國國家醫學圖書館
的MeSH (medical subheading)， 已經可以同
時以自然語言及MeSH進行搜尋
優點 缺點
自然語言 可搜尋似是而非或未
經索引分類的主題
可能會得到許多不相
關的文獻，未考慮同
義字或時態/語系差異
索引 可透過索引可歸類相
關同義字
須重複檢索較花時間
Note

15. Tip #1 MeSH名詞
15
} 的索引名詞 (index term) - MeSH名詞
- 搜尋語法:
PubMed會自動檢索關鍵字是否有對應的MeSH名詞，甚至
進一步對應出兩個以上MeSH名詞，要限定只搜尋特定
MeSH名詞，可鍵入”smoking cessation” [mesh]
語法 功能
MeSH名詞 [mesh] 搜尋標有該MeSH名詞的文章
MeSH名詞主題 [majr] 搜尋以該MeSH名詞為主題的文章
Note
MeSH名詞 Smoking cessation [mesh] 15837
MeSH名詞主題 Smoking cessation [majr] 10840

16. Tip #1 MeSH名詞
16
} 以MeSH名詞搜尋並非萬無一失
- PubMed常見狀態分類 (status subset)
還沒加工完畢的文章，僅用MeSH名詞是搜尋不到的!!
標籤 狀態 MeSH 篇數
as supplied by publisher 出版商提供引用 - 381428
in process 加工中 - 418151
indexed for MEDLINE 加工完畢 ◎ 19035076
Note

17. 在 裡，限制 (limit) 文獻類型是基本功
但「限制」裡面沒有的，該怎麼辦?
Question #2
17

18. Tip #2 副標題
18
} 常用MeSH名詞副標題 (subheading) 組合
varenicline/drug therapy (後面不需加上[mh])
簡寫 副標題 用途
AE Adverse effects 不良反應相關研究
DT Drug therapy 藥物治療相關研究
DU Diagnostic use 作為診斷工具研究
PK Pharmacokinetics 藥物動力學研究
PD Pharmacology 藥理學相關研究
PO Poisoning 毒理相關研究
PC Prevention and control 預防相關研究
TU Therapeutic use 治療用途研究

19. Tip #2 副標題
19
} 常用MeSH名詞副標題 (subheading) 組合
- 試著以「 varenicline 」為關鍵字搜尋
關鍵字 副標題 篇數*
varenicline
/adverse effects 258
/drug therapy 319
/diagnostic use 5
/pharmacokinetics 48
/pharmacology 416
/poisoning 18
/prevention and control 120
/therapeutic use 503

20. 的布林字元 (Bollean operators) 不是只有
”AND”跟”OR”喔!!
Question #3
20

21. Tip #3 布林字元
21
} 中使用的布林字元 (Boolean operators)
許多符號會被PubMed自動忽略，例如「! $ % + -」
字元 代表意義 功能
AND 交集 (and) 搜尋同時包括A與B關鍵字
OR 聯集 (or) 搜尋同時包括A或B關鍵字
NOT 去除 (not) 搜尋包括A但不包括B關鍵字
NEAR 接近 (near) 搜尋特定順序關鍵字
() 括號 (brackets) 合併不同布林字元
“” 引號 (quotes) 將引號內關鍵字視為一體
[] 中括號 (square brackets) 搜尋特定指令
* 星號 (asterisk) 截斷字元
Note

22. 我要限制的東西真的太多了，可不可以一次搞定?
Question #4
22

23. Tip #4 限定標籤
23
} 常用的 標籤 (tag) 包括:
指令 用途 範例
[LA] 限制語言 eng [LA]、chi [LA]
[PT] 限制文獻種類 Meta-analysis [PT]
[TIAB] 限制關鍵字出現在標題/
摘要
“smoking cessation
[TIAB]”
[DP] 限制發表年份 “2007:2011 [DP]”
[MH] 以MeSH名詞搜尋 “smoking cessation [MH]”
[SH] 以MeSH名詞副標題搜尋 “smoking/drug therapy
[SH]”
[PL] 搜尋文獻發表國家 “smoking cessation [PL]”

24. Tip #4 限定標籤
24
} 常用的 標籤 (tag) 包括:
- 試著以「 varenicline 」為關鍵字搜尋
關鍵字 願望 語法 篇數*
varenicline
英文文獻 eng [LA] 611
綜合分析 Meta-analysis
[PT]
18
標題裡面一定要有關
鍵字
[TIAB] 577
2008年至2012年文獻 2008:2012 [DP] 542
以Mesh名詞搜尋 [MESH] -
發表國家為英國 England [PL] 178

25. Tip #4 限定標籤
25
} 當然，我知道你要的不只這樣…放心大膽地輸進去…

26. 我只要病例報告 (case report)，還要花時間
從幾百篇文獻中挑選哪些是病例報告真的很浪費
時間，該怎麼辦?
Question #5
26

27. Tip #5 特定文章類型
27
} 指定文章類型 (publication type)
指定文章種類只能搜尋到已經收納到MEDLINE的文章
研究類型 關鍵字
病例報告 Case reports [PT]
臨床研究 Clinical trial [PT]
控制性臨床研究 Controlled clinical trial [PT]
綜合分析 Meta-analysis [PT]
執業指引 Practice guideline [PT]
隨機分派研究 Randomized controlled trial [PT]
傳統綜論 Review [PT]
Note

28. Tip #5 特定文章類型
28
} 指定文章類型 (publication type)
- 測試搜尋「varenicline引起藥物不良反應的病例報告」
- 測試搜尋「varenicline的隨機分派控制研究」
關鍵字 願望 語法 篇數*
varenicline
藥物不良反應 /adverse effects 258
病例報告 case reports [PT] 50
一次搞定 /adverse effects & case
reports [PT]
34
關鍵字 願望 語法 篇數*
varenicline
隨機分派研究 randomized controlled
trial [PT]
65

29. 為什麼要把臨床問題轉換成「PICO」?
對搜尋有幫助嗎?
Question #6
29

30. Tip #6 PICO搜尋框架
30
} 搜尋框架 (framework)「PICO」搜尋法
一般原則是先放「P」與「I」，「C」與「O」視搜尋結果
決定
P (patient) I (intervention)
O (outcome)
我們要的
Note

31. Tip #6 PICO搜尋框架
31
} 搜尋框架 (framework)「PICO」搜尋法
- 測試「varenicline是否會增加心臟血管疾病發生率?」
關鍵字 同義字 MeSH名詞
smoking tobacco user tobacco use disorder
varenicline chantix、champix -
nicotine
replacement
therapy
transdermal
nicotine patch、
nicotine gum、
nicotine lozenge
nicotine/therapeutic
use
cardiovasc-
ular disease
heart disease cardiovascular
diseases
P
I
C
O

32. } 測試PICO搜尋框架
使用PICO搜尋框架可以增加搜尋效率，且保有一定專一度
搜尋 字串 結果
1 (smoking | tobacco user | tobacco use disorder) 174514
2 (varenicline | chantix | champix) 671
3 (nicotine replacement therapy | nicotine gum |
nicotine patch | nicotine lozenge)
4233
4 (cardiovascular diseases | heart disease) 1779729
5 #1 & #2 577
6 #1 & #2 & #3 196
7 #1 & #2 & #3 & #4 16
Tip #6 PICO搜尋框架
32
Note

33. 可不可以直接針對臨床問題種類，
找出最能解決問題的文獻?
Question #7
33

34. } 研究方法篩選 (research methodology filter)
PubMed clinical query已經內建上述常用篩選功能，使用
者僅需指定「問題種類 (category)」與「範圍 (scope)」
Tip #7 篩選器
34
問題種類/最佳研究設計 檢索語法
共同/系統性綜論 systematic [SB]
治療/隨機分派研究 AND (Therapy/Narrow[filter])
病因/隨機、世代或病例控制研究 AND (Etiology/Narrow[filter])
診斷/斷面或世代研究 AND (Diagnosis/Narrow[filter])
預後/世代研究 AND (Prognosis/Narrow[filter])
Note

35. } 研究方法篩選器解析
- 系統性綜論 (systematic review) systematic [sb]
Tip #7 篩選器
35
OVID系統 PubMed系統 敏感度/專一度
MEDLINE.tw. OR
systematic review.tw.
OR meta analysis.pt.
MEDLINE [TIAB] OR
(systematic [TIAB] AND
review [TIAB]) OR meta
analysis [PT]
71%/99.2%
search:.tw. OR
meta analysis.mp,pt.
OR review.pt. OR
di.xs. OR
associated.tw.
search*[TIAB] OR meta
analysis [PT] OR meta
analysis [TIAB] OR meta
analysis [MH] OR review
[PT] OR diagnosis [MH] OR
associated [TIAB]
99.5%/52%

36. } 研究方法篩選 (research methodology filter)
- 試著以「 varenicline 」為關鍵字搜尋
治療型問題篩選器主要要找隨機分派研究，但搜尋結果會與
「限制」隨機分派研究有所差異
Tip #7 篩選器
36
關鍵字 問題/最佳研究設計 語法 篇數*
varenicline
共同/系統性綜論 systematic [SB] 51
治療/隨機分派研究 Therapy/Narrow [filter] 80
病因/隨機、世代或病
例控制研究
Etiology/Narrow [filter] 56
診斷/斷面或世代研究 Diagnosis/Narrow [filter] 1
預後/世代研究 Prognosis/Narrow [filter] 29
Note

37. 測試搜尋
37
} 擬訂關鍵字、同義字與MeSH名詞 (耗時3分鐘 )
自然語言 (關鍵字、同義字) 增加靈敏度，配合索引 (MeSH
名詞) 可增加專一度
關鍵字 同義字 MeSH名詞
smoking tobacco user tobacco use disorder
varenicline chantix、champix -
nicotine
replacement
therapy
transdermal
nicotine patch、
nicotine gum、
nicotine lozenge
nicotine/therapeutic
use
abstinence point prevalence
abstinence
smoking cessation
P
I
C
O

38. } 測試PICO搜尋框架 (耗時6分鐘 )
搜尋 字串 結果
1 (smoking | tobacco user | tobacco use disorder) 169966
2 (varenicline | chantix | champix) 606
3 (nicotine replacement therapy | nicotine gum |
nicotine patch | nicotine lozenge)
3646
4 (abstinence | point prevalence abstinence |
smoking cessation)
33948
5 #1 & #2 529
6 #1 & #2 & #3 174
7 #1 & #2 & #3 & #4 170
練習一下
38

39. 練習一下
39
} 停下來想一想 (耗時一分鐘 )
想法 內容
1 病人的問題清楚指出了varenicline且這個藥物目前僅用
於輔助戒菸
2 治療型問題優先搜尋收納隨機分派研究的系統性綜論
(systematic review)
3 #1 AND #2
搜尋 字串 結果
1 (varenicline | chantix | champix) systematic [sb] 41

40. 搜尋結果
40
} 如何呈現搜尋結果?
搜尋效率可以用單位時間 (或步驟) 內減少至符合臨床問題及
納入條件的文獻篇數表現
X篇
X篇
X篇
X篇CENTRAL|
搜尋結果 符合臨床問題
X篇重複
X篇不符
X篇
X篇
納入評讀
X篇…納入
Note

41. } 如何進行搜尋診斷 (效率導向)?
建議先進行熱身搜尋 (warm-up search)，先調整專一度再
修正敏感度
問題 現象 嚴重度 解決之道
敏感度太高 搜尋到的文獻
數目太多
★★★★★ 限制或篩選文獻
類型
敏感度太低 搜尋到的文獻
數目太少
★★★★★ 增加同義字、移
除限制
專一度太低 符合「PICO」
的文獻太少
★★★★★ 必須重新修正關
鍵字
搜尋診斷
41
Note

42. 我歪打正著找到一篇「不錯的」，
有辦法找到類似的嗎?
Question #8
42

43. } 比對相關文獻 (related citations) 功能
內建語法會根據摘要、標題與MeSH名詞，配合字元權重計
算出最接近的鄰居 (neighborhood)
Tip #8 找出相關文獻
43
Note

44. 什麼是執業指引? 在 裡面如何搜尋?
還有其他資料庫可供使用嗎?
Question #9
44

45. } 利用執業指引標籤 (tag) 功能
- 搜尋「戒菸 (smoking cessation)」的執業指引
} NGC (National Guideline Clearinghouse) 指引集散地
- http://www.guideline.gov/
Tip #9 如何搜尋執業指引?
45
關鍵字 願望 語法 篇數
smoking
cessation |
tobacco use
disorder
執業指引 practice guideline [pt] 135
關鍵字 願望 語法 篇數
smoking cessation |
tobacco use disorder
執業指引 - 212

46. } NGC (National Guideline Clearinghouse) 指引集散地
- 在進階搜尋 (advanced search) 功能中可以進一步限制
Tip #9 如何搜尋執業指引?
46
關鍵字 限制 篇數
smoking cessation |
tobacco use disorder
成人 (19~44歲)、專家共識、
疾病相關醫學會、學術機構
59

47. } NGC (National Guideline Clearinghouse) 指引集散地
- 點選搜尋結果可以看到指引摘要 (guideline summary)
Tip #9 如何搜尋執業指引?
47
指引標題
指引來源
經過消化過的指引內容

48. } 已經可以以相關性 (relevance) 排序，最新的
文獻不一定是最相關的 (符合臨床問題) 或 較能解決問題的
(證據品質較佳)
挑選文獻
48

49. 聽了那麼多，搜尋的功力有提升嗎?
Question #10
49