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Unidad 3. Nutrición, metabolismo,
  crecimiento y control de microorganismos
Objetivos
•     Conocer
    -Las características de los principales grupos nutricionales de microorganismos, su
          crecimiento y control
    -Las diferentes aplicaciones de la microbiología
    -Las peculiaridades metabólicas de los microorganismos y su diversidad
    -Las pautas del crecimiento microbiano y los factores que lo influyen
    -Los agentes antimicrobianos más comunes y sus mecanismos de acción
•     Asimilar
    -El mantenimiento adecuado de cultivos puros de microorganismos solo es posible
          con la práctica de técnicas asépticas
    -El metabolismo microbiano es enormemente versátil y plástico
•     Capacidad
    -Prepara cultivos y manejar varias técnicas de esterilización
    -Realizar técnicas básicas de recuento de bacterias
    -Aislar microorganismos
    -Actualizar su formación y necesidades en microbiología a través del manejo
          herramientas bioinformáticas
Unidad 3. Nutrición, metabolismo,
crecimiento y control de
microorganismos
Capítulo 5. Nutrición: Requerimientos,
toma de nutrientes, medios de cultivo,
aislamiento de cultivos puros
Requerimientos
•Requerimientos nutritivos esenciales
       macroelementos (macronutrientes)
               -C, O, H, N, S, P, K, Ca, Mg, y Fe
               -son requeridos en cantidades relativamente altas
       micronutrientes (elementos traza o oligoelementos)
               -Mn, Zn, Co, Mo, Ni, y Cu
               -son requeridos en cantidades traza
               frecuentemente suministrado entre las impurezas del agua
               o los componentes del medio de cultivo



 •Requerimientos de carbono, hidrógeno y oxígeno
         -Normalmente se satisfacen simultáneamente
         -Autótrofos (emplean dióxido de carbono como única o principal
 fuente de carbono)
         Heterótrofos (emplean moléculas orgánicas como fuente de carbono)
Requerimientos

   Tipos nutricionales de microorganismos
Requerimientos




 mixotrofos: combinan diferentes procesos metabólicos, por ej.
 quimiolitoautotróficos y heterotróficos
    •fuente de energía química inorgánica
    •fuente de H/e- inorgánica
    •fuente orgánica de carbono
Requerimientos

Requerimientos de nitrógeno, fósforo y azufre
   • necesario para la síntesis de importantes moléculas (ej.,
     aminoácidos, ácidos nucleicos)
   • el nitrógeno se puede suministrar de muchas formas
   • el fósforo se suministra en general en forma de fósforo
     inorgánico
   • el azufre se suministra en general en forma de sulfato y
     se adquiere a través de la vía asimilatoria de reducción
     de sulfato


Fuentes de nitrógeno
• moléculas orgánicas
• amonio
• nitrato y nitrito a través de sus vías de asimilación
• nitrógeno gas a través de la fijación de nitrógeno
Requerimientos

 Factores de crecimiento
    •   compuestos orgánicos
    •   componentes esenciales (o sus precursores) que la célula no puede
        sintetizar
    •   deben ser suministrados por el ambiente en el que crece la célula para
        que la célula sobreviva y se reproduzca


  Importancia práctica de los factores de crecimiento
    •   desarrollo de ensayos cuantitativos crecimiento-respuesta para
        determinar la concentración de factores de crecimiento en preparaciones
    •   producción industrial de factores de crecimiento por microorganismos
Requerimientos
                     Clases de factores de crecimiento
•   aminoácidos, necesarios para la síntesis de proteínas
•   purinas y pirimidinas, necesarios para la síntesis de ácidos nucleicos
•   vitaminas, funcionan como cofactores enzimáticos
Toma de nutrientes   Captación celular de nutrientes
Los mecanismos más comunes son 3:
• difusión facilitada
• transporte activo
• translocación de grupos
Difusión facilitada
•   similar a la difusión pasiva
     – el movimiento de moléculas no es                            Efecto de
        dependiente de energía                                     saturación del
     – el movimiento de las moléculas es                           transportador
        desde la alta concentración a la
        baja concentración
     – la diferencia de concentración (el
        gradiente) determina la velocidad
        de toma
•   difiere de la difusión pasiva
     – emplea moléculas transportadoras
        (poros y canales)
     – una pequeña concentración de
        gradiente es necesaria para que
        haya una toma significativa de
        moléculas                         •la velocidad de difusión facilitada
     – transporta efectivamente glicerol,
        azucares y aminoácidos            aumenta más rápidamente y a menores
•   más común en células eucariotas que concentraciones
    en procariotas                        •la difusión facilitada alcanza un máximo
                                          cuando el transportador se satura
Toma de nutrientes
                             Transporte activo
• el proceso es dependiente de energía
    – ATP o fuerza protomotriz
• movilizan las moléculas en contra del gradiente
• concentra las moléculas en el interior celular
• requiere proteínas transportadoras (transportadores y
  translocadores)
    – se observa un efecto de saturación del transportador

                         Mediado por ATP
ABC transportadores
•   contienen una proteína
    a la que se une el ATP
•   se observa en
    bacterias, arqueas y
    eucariotas
•   algunos confieren
    resistencia a
    antibióticos
Toma de nutrientes

                              El transporte de
                              electrones se emplea
Mediado por gradiente         para bombear protones
                              al exterior de la
de protones y sodio           membrana

                              El gradiente de
                              protones dirige la
                              expulsión de sodio
•   Simporte                  mediante un mecanismo
                              de antiporte
     – se transportan dos
       sustancias en la       El sodio se une al
                              complejo proteico
       misma dirección        transportador
•   Antiporte
     – se transportan dos
                              La unión del sodio
       sustancias en          provoca un cambio
       direcciones opuestas   conformacional hace
                              posible la unión de otra
                              molécula a transportar


                              Esto hace que se
                              liberen ambas
                              moléculas en el interior
                              (mecanismo de
                              simporte)
Toma de nutrientes       Traslocación de grupo
•   las moléculas son modificadas a medida que se transportan a través de la
    membrana
•   es un proceso dependiente de energía
•   ej. el sistema fosfotrasferasa de E. coli

Sistema fosfotransferasa de Escherichia
coli
Toma de nutrientes
                     Captación de hierro

                     • el ión férrico es muy insoluble
                       y su captación en difícil
                     • los microorganismos emplean
                       sideróforos para poder
                       captarlo más eficazmente
                     • los sideróforos forman
                       complejos con el ión férrico
                     • el complejo es posteriormente
                       transportado al interior celular
                     • algunos patógenos animales
                       pueden captar grupos hemo
Toma de nutrientes

  Clasificación de las proteínas
  transportadoras de la membrana
   1. Poros y canales
        1.A Canales α-Helicoidales
        1.B Porinas de hojas plegadas β
        1.C Toxinas formadoras de poros
        1.D Canales de síntesis no ribosómica
        1.E Holinas
    2. Transportadores dependientes del potencial electroquímico
        2.A Transportadores (uniporters, simporters y antiporters)
        2.B Transportadores de síntesis no ribosómica
    3. Transportadores primarios
        3.A Dependientes de un grupo fosfato (ABC)
        3.B Dependientes de descarboxilaciones
        3.C Dependientes de la transferencia de grupos metilo
        3.D Dependientes de oxidoreducción
        3.E Dependientes de luz
    4. Traslocadores de grupos
    5. Transportadores de electrones
                     International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) 2002
Medios de cultivo
                                Medios de cultivo
• preparación líquida (caldo) o sólida (agar) utilizada para el crecimiento,
  transporte o mantenimiento de microorganismos
    – los medios sólidos se solidifican generalmente con agar
• fundamentales para el estudio de los microorganismos



Medios sintéticos o definidos

•     se conocen todos sus
      componentes y su concentración
Medios de cultivo




Medios complejos
•   contiene algunos
    componentes de
    composición y/o
    concentración
    desconocida
Medios de cultivo
    Algunos componentes de los medios de cultivo
•   peptonas
     – hidrolizados de proteínas obtenidos tras la digestión parcial de varias fuentes de
        proteínas (carne, caseína, harina de soja, gelatina)
          • Peptona ácida de caseína: Digestión ácida de la caseína (proteína mayoritaria
            de la leche) a aminoácidos, a excepción de triptófano que prácticamente
            desaparece. También desaparecen las vitaminas durante su obtención
          • Peptona de carne: Digestión parcial con la proteasa pepsina.
          • Peptona de gelatina: Digestión pancreática de gelatina. Tiene bajo contenido e
            cisteína y triptófano y ausencia total de azúcares fermentables. Poder nutritivo
            bajo. Se utiliza con microorganismos poco exigentes.
          • Peptona pancreática de caseína: Digestión de caseína con extractos
            pancreáticos. Es el más utilizado en procesos de fermentación industrial.
          • Peptona de soja: Digestión con la proteasa papaina de la harina de soja. Por s
            alto contenido en azucares no es recomendable en estudios de fermentación.
          • Peptona trípsica de caseína: Digestión con la proteasa trípsina de la caseina
•   extractos
     – extractos acuosos frecuentemente de carne o levadura
•   agar
     – polímero sulfatado normalmente extraído de algas rojas empleado para solidificar
        medios líquidos. Funde a 80-90 ºC y solidifica a 40-42 ºC. No es degradado por la
        mayor parte de los microorganismos
Medios de cultivo
                                 Tipos de medios
•   Medios para fines generales
     – pueden mantener el crecimiento de numerosos microorganismos
     – ej. : caldo de triptona y soja
•   medios enriquecidos
     – medios para fines generales suplementados con sangre o otros nutrientes
       especiles
     – ej.: agar sangre

•   medios selectivos
     – favorecen el crecimiento de algunos microorganismos e inhiben el crecimiento
       de otros
     – ej.: agar MacConkey
         • selecciona bacteria gram negativas por contener cristal violeta

•   medios diferenciales
     – diferencian entre grupos distintos de bacterias e incluso permiten una
       identificación tentativa
     – ej., agar sangre: diferencia bacterias hemolíticas de no hemolíticas
              – muchos estreptococos y estafilococos aislados de la garganta producen
                 zonas claras alrededor de sus colonias debido a la lisis de los eritrocitos
     – ej., Agar MacConkey: diferencia fermentadores de lactosa de no fermentadores
Aislamiento de cultivos puros

•    cultivo puro
                  Aislamiento de cultivos puros
      – población de células que proviene de una sola célula
•    Para aislar cultivos puros se emplean frecuentemente la siembra en
     profundidad, la siembra por extensión y la siembra en estría


    Siembra en profundidad
    •La muestra original se diluye
    varias veces para reducir la
    concentración bacteriana, se
    mezcla con agar templado y se
    vierte
Aislamiento de cultivos puros

  Siembra por extensión
  •La muestra original se diluye varias veces para reducir la concentración
  bacteriana, se vierte sobre una superficie de agar y se extiende con un asa
  de Digralski de forma que las colonias resultantes estén bien separadas
Aislamiento de cultivos puros

  Siembra en estría
  •La muestra original (sólida o líquida) se recoge con un asa de siembra y se
  aplica secuencialmente en estrías esterilizando el asa entre estría y estría


   •En cada estría se va
   diluyendo la muestra
   original de forma que en la
   última estría se obtienen
   bacterias que darán lugar a
   colonias aisladas
Aislamiento de cultivos puros
             Morfología de la colonia
las especies de microorganismos forman colonias de aspecto característico


 Forma
             Puntiforme     Circular Filamentoso Irregular   Rizoide   Fusiforme


 Elevación
              Plana              Elevada   Convexa    Pulvinada   Umbonada



 Margen
                Entero     Ondulado Lobulado Erosionado Filamentoso Rizado
Aislamiento de cultivos puros

la morfología de la colonia
puede variar según el medio en
el que crezca.
Ej, Bacillus subtilis creciendo en
un medio pobre en nutrientes



Crecimiento de colonias
•   la colonia crece más
    rápidamente en la periferia
     – hay más disponibilidad de
        oxígeno y nutrientes en la
        periferia
•   el crecimiento es más lento en
    el centro de la colonia, hay
    mayor mortalidad
•   en la naturaleza muchos
    microorganismos se agrupan
    formando biofilms
Medios de cultivo
 ¿Dónde encuentro la composición de los medios de
 cultivo o los medios preparados?
       • En las páginas web de los suministradores de organismos. Por ejemplo: La
         ATCC (http://www.atcc.org, la colección americana de cultivos tipo) indica la
         composición del medio de cultivo junto a los organismos que suministra. Lo
         mismo sucede con la CECT (www.cect.org, colección española de cultivos
         tipo)
       • La composición detallada de cada medio se encuentra en las páginas de los
         proveedores de medios de cultivo. El más detallado es el manual DIFCO (
         http://www.maplica.com)
       • En España los suministradores más comunes son Microkit (http://
         www.laboratoriosmicrokit.com/) , Sigma Aldrich
         http://www.sigmaaldrich.com/Area_of_Interest/Analytical__Chromatography/Mi
          y biomerieux (http://www.biomerieux.com)

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5. NutricióN

  • 1. Unidad 3. Nutrición, metabolismo, crecimiento y control de microorganismos Objetivos • Conocer -Las características de los principales grupos nutricionales de microorganismos, su crecimiento y control -Las diferentes aplicaciones de la microbiología -Las peculiaridades metabólicas de los microorganismos y su diversidad -Las pautas del crecimiento microbiano y los factores que lo influyen -Los agentes antimicrobianos más comunes y sus mecanismos de acción • Asimilar -El mantenimiento adecuado de cultivos puros de microorganismos solo es posible con la práctica de técnicas asépticas -El metabolismo microbiano es enormemente versátil y plástico • Capacidad -Prepara cultivos y manejar varias técnicas de esterilización -Realizar técnicas básicas de recuento de bacterias -Aislar microorganismos -Actualizar su formación y necesidades en microbiología a través del manejo herramientas bioinformáticas
  • 2. Unidad 3. Nutrición, metabolismo, crecimiento y control de microorganismos Capítulo 5. Nutrición: Requerimientos, toma de nutrientes, medios de cultivo, aislamiento de cultivos puros
  • 3. Requerimientos •Requerimientos nutritivos esenciales macroelementos (macronutrientes) -C, O, H, N, S, P, K, Ca, Mg, y Fe -son requeridos en cantidades relativamente altas micronutrientes (elementos traza o oligoelementos) -Mn, Zn, Co, Mo, Ni, y Cu -son requeridos en cantidades traza frecuentemente suministrado entre las impurezas del agua o los componentes del medio de cultivo •Requerimientos de carbono, hidrógeno y oxígeno -Normalmente se satisfacen simultáneamente -Autótrofos (emplean dióxido de carbono como única o principal fuente de carbono) Heterótrofos (emplean moléculas orgánicas como fuente de carbono)
  • 4. Requerimientos Tipos nutricionales de microorganismos
  • 5. Requerimientos mixotrofos: combinan diferentes procesos metabólicos, por ej. quimiolitoautotróficos y heterotróficos •fuente de energía química inorgánica •fuente de H/e- inorgánica •fuente orgánica de carbono
  • 6. Requerimientos Requerimientos de nitrógeno, fósforo y azufre • necesario para la síntesis de importantes moléculas (ej., aminoácidos, ácidos nucleicos) • el nitrógeno se puede suministrar de muchas formas • el fósforo se suministra en general en forma de fósforo inorgánico • el azufre se suministra en general en forma de sulfato y se adquiere a través de la vía asimilatoria de reducción de sulfato Fuentes de nitrógeno • moléculas orgánicas • amonio • nitrato y nitrito a través de sus vías de asimilación • nitrógeno gas a través de la fijación de nitrógeno
  • 7. Requerimientos Factores de crecimiento • compuestos orgánicos • componentes esenciales (o sus precursores) que la célula no puede sintetizar • deben ser suministrados por el ambiente en el que crece la célula para que la célula sobreviva y se reproduzca Importancia práctica de los factores de crecimiento • desarrollo de ensayos cuantitativos crecimiento-respuesta para determinar la concentración de factores de crecimiento en preparaciones • producción industrial de factores de crecimiento por microorganismos
  • 8. Requerimientos Clases de factores de crecimiento • aminoácidos, necesarios para la síntesis de proteínas • purinas y pirimidinas, necesarios para la síntesis de ácidos nucleicos • vitaminas, funcionan como cofactores enzimáticos
  • 9. Toma de nutrientes Captación celular de nutrientes Los mecanismos más comunes son 3: • difusión facilitada • transporte activo • translocación de grupos Difusión facilitada • similar a la difusión pasiva – el movimiento de moléculas no es Efecto de dependiente de energía saturación del – el movimiento de las moléculas es transportador desde la alta concentración a la baja concentración – la diferencia de concentración (el gradiente) determina la velocidad de toma • difiere de la difusión pasiva – emplea moléculas transportadoras (poros y canales) – una pequeña concentración de gradiente es necesaria para que haya una toma significativa de moléculas •la velocidad de difusión facilitada – transporta efectivamente glicerol, azucares y aminoácidos aumenta más rápidamente y a menores • más común en células eucariotas que concentraciones en procariotas •la difusión facilitada alcanza un máximo cuando el transportador se satura
  • 10. Toma de nutrientes Transporte activo • el proceso es dependiente de energía – ATP o fuerza protomotriz • movilizan las moléculas en contra del gradiente • concentra las moléculas en el interior celular • requiere proteínas transportadoras (transportadores y translocadores) – se observa un efecto de saturación del transportador Mediado por ATP ABC transportadores • contienen una proteína a la que se une el ATP • se observa en bacterias, arqueas y eucariotas • algunos confieren resistencia a antibióticos
  • 11. Toma de nutrientes El transporte de electrones se emplea Mediado por gradiente para bombear protones al exterior de la de protones y sodio membrana El gradiente de protones dirige la expulsión de sodio • Simporte mediante un mecanismo de antiporte – se transportan dos sustancias en la El sodio se une al complejo proteico misma dirección transportador • Antiporte – se transportan dos La unión del sodio sustancias en provoca un cambio direcciones opuestas conformacional hace posible la unión de otra molécula a transportar Esto hace que se liberen ambas moléculas en el interior (mecanismo de simporte)
  • 12. Toma de nutrientes Traslocación de grupo • las moléculas son modificadas a medida que se transportan a través de la membrana • es un proceso dependiente de energía • ej. el sistema fosfotrasferasa de E. coli Sistema fosfotransferasa de Escherichia coli
  • 13. Toma de nutrientes Captación de hierro • el ión férrico es muy insoluble y su captación en difícil • los microorganismos emplean sideróforos para poder captarlo más eficazmente • los sideróforos forman complejos con el ión férrico • el complejo es posteriormente transportado al interior celular • algunos patógenos animales pueden captar grupos hemo
  • 14. Toma de nutrientes Clasificación de las proteínas transportadoras de la membrana 1. Poros y canales 1.A Canales α-Helicoidales 1.B Porinas de hojas plegadas β 1.C Toxinas formadoras de poros 1.D Canales de síntesis no ribosómica 1.E Holinas 2. Transportadores dependientes del potencial electroquímico 2.A Transportadores (uniporters, simporters y antiporters) 2.B Transportadores de síntesis no ribosómica 3. Transportadores primarios 3.A Dependientes de un grupo fosfato (ABC) 3.B Dependientes de descarboxilaciones 3.C Dependientes de la transferencia de grupos metilo 3.D Dependientes de oxidoreducción 3.E Dependientes de luz 4. Traslocadores de grupos 5. Transportadores de electrones International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) 2002
  • 15. Medios de cultivo Medios de cultivo • preparación líquida (caldo) o sólida (agar) utilizada para el crecimiento, transporte o mantenimiento de microorganismos – los medios sólidos se solidifican generalmente con agar • fundamentales para el estudio de los microorganismos Medios sintéticos o definidos • se conocen todos sus componentes y su concentración
  • 16. Medios de cultivo Medios complejos • contiene algunos componentes de composición y/o concentración desconocida
  • 17. Medios de cultivo Algunos componentes de los medios de cultivo • peptonas – hidrolizados de proteínas obtenidos tras la digestión parcial de varias fuentes de proteínas (carne, caseína, harina de soja, gelatina) • Peptona ácida de caseína: Digestión ácida de la caseína (proteína mayoritaria de la leche) a aminoácidos, a excepción de triptófano que prácticamente desaparece. También desaparecen las vitaminas durante su obtención • Peptona de carne: Digestión parcial con la proteasa pepsina. • Peptona de gelatina: Digestión pancreática de gelatina. Tiene bajo contenido e cisteína y triptófano y ausencia total de azúcares fermentables. Poder nutritivo bajo. Se utiliza con microorganismos poco exigentes. • Peptona pancreática de caseína: Digestión de caseína con extractos pancreáticos. Es el más utilizado en procesos de fermentación industrial. • Peptona de soja: Digestión con la proteasa papaina de la harina de soja. Por s alto contenido en azucares no es recomendable en estudios de fermentación. • Peptona trípsica de caseína: Digestión con la proteasa trípsina de la caseina • extractos – extractos acuosos frecuentemente de carne o levadura • agar – polímero sulfatado normalmente extraído de algas rojas empleado para solidificar medios líquidos. Funde a 80-90 ºC y solidifica a 40-42 ºC. No es degradado por la mayor parte de los microorganismos
  • 18. Medios de cultivo Tipos de medios • Medios para fines generales – pueden mantener el crecimiento de numerosos microorganismos – ej. : caldo de triptona y soja • medios enriquecidos – medios para fines generales suplementados con sangre o otros nutrientes especiles – ej.: agar sangre • medios selectivos – favorecen el crecimiento de algunos microorganismos e inhiben el crecimiento de otros – ej.: agar MacConkey • selecciona bacteria gram negativas por contener cristal violeta • medios diferenciales – diferencian entre grupos distintos de bacterias e incluso permiten una identificación tentativa – ej., agar sangre: diferencia bacterias hemolíticas de no hemolíticas – muchos estreptococos y estafilococos aislados de la garganta producen zonas claras alrededor de sus colonias debido a la lisis de los eritrocitos – ej., Agar MacConkey: diferencia fermentadores de lactosa de no fermentadores
  • 19. Aislamiento de cultivos puros • cultivo puro Aislamiento de cultivos puros – población de células que proviene de una sola célula • Para aislar cultivos puros se emplean frecuentemente la siembra en profundidad, la siembra por extensión y la siembra en estría Siembra en profundidad •La muestra original se diluye varias veces para reducir la concentración bacteriana, se mezcla con agar templado y se vierte
  • 20. Aislamiento de cultivos puros Siembra por extensión •La muestra original se diluye varias veces para reducir la concentración bacteriana, se vierte sobre una superficie de agar y se extiende con un asa de Digralski de forma que las colonias resultantes estén bien separadas
  • 21. Aislamiento de cultivos puros Siembra en estría •La muestra original (sólida o líquida) se recoge con un asa de siembra y se aplica secuencialmente en estrías esterilizando el asa entre estría y estría •En cada estría se va diluyendo la muestra original de forma que en la última estría se obtienen bacterias que darán lugar a colonias aisladas
  • 22. Aislamiento de cultivos puros Morfología de la colonia las especies de microorganismos forman colonias de aspecto característico Forma Puntiforme Circular Filamentoso Irregular Rizoide Fusiforme Elevación Plana Elevada Convexa Pulvinada Umbonada Margen Entero Ondulado Lobulado Erosionado Filamentoso Rizado
  • 23. Aislamiento de cultivos puros la morfología de la colonia puede variar según el medio en el que crezca. Ej, Bacillus subtilis creciendo en un medio pobre en nutrientes Crecimiento de colonias • la colonia crece más rápidamente en la periferia – hay más disponibilidad de oxígeno y nutrientes en la periferia • el crecimiento es más lento en el centro de la colonia, hay mayor mortalidad • en la naturaleza muchos microorganismos se agrupan formando biofilms
  • 24. Medios de cultivo ¿Dónde encuentro la composición de los medios de cultivo o los medios preparados? • En las páginas web de los suministradores de organismos. Por ejemplo: La ATCC (http://www.atcc.org, la colección americana de cultivos tipo) indica la composición del medio de cultivo junto a los organismos que suministra. Lo mismo sucede con la CECT (www.cect.org, colección española de cultivos tipo) • La composición detallada de cada medio se encuentra en las páginas de los proveedores de medios de cultivo. El más detallado es el manual DIFCO ( http://www.maplica.com) • En España los suministradores más comunes son Microkit (http:// www.laboratoriosmicrokit.com/) , Sigma Aldrich http://www.sigmaaldrich.com/Area_of_Interest/Analytical__Chromatography/Mi y biomerieux (http://www.biomerieux.com)