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一般化線形モデル色々
Gamma回帰と対数線形モデル
1
2
一般化線形モデルをマスターしよう
予測と確率分布
尤度と最尤法
一般化線形モデル基礎
Devianceと尤度比検定
一般化線形モデル色々
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ゼロ切断・過剰モデル、 一般化線形混合モデル
3
今回やること
1.ポアソン回帰をもっと使いこなす
• CPUE標準化
• Offset項
2.ロジスティック回帰
3.ガンマ回帰
4.対数線形モデル
4
今回やること
3.ガンマ回帰
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リンク関数はlogやinverse
5
ガンマ分布
0未満にならない連続データに使用する
𝑒− 𝑥
𝜃 𝑥 𝑘−1
Γ 𝑘
k : 形状母数
θ : 尺度母数
6
実演
7
今回やること
1.ポアソン回帰をもっと使いこなす
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• Offset項
2.ロジスティック回帰
3.ガンマ回帰
4.対数線形モデル
8
今回やること
4.対数線形モデル
分割表の検定
独立性の検定や𝜒2
検定という名前で有名
9
分割表の検定
例)ナマズが騒ぐと地震が起きるか?
地震が起こった時ナマズが騒いだ回数 :30回
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ナマズが騒ぐと地震が起きる!!
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10
分割表の検定
例)ナマズが騒ぐと地震が起きるか?
地震が起こった時ナマズが騒いだ回数 :30回
地震が起こった時ナマズが騒がなかった回数 :10回
地震が起こらなかった時ナマズが騒いだ回数 : 300回
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11
分割表の検定
例)ナマズが騒ぐと地震が起きるか?
ナマズ
地震
あった なかった 合計
騒いだ 30 300 330
じっとしてた 10 100 110
合計 40 400 440
ナマズ
地震
あった なかった 合計
騒いだ 30 10 40
じっとしてた 10 390 400
合計 40 400 440
ナマズ
関係なし
ナマズ
最強!!
12
分割表でGLM
ナマズ
地震
あった なかった 合計
騒いだ 30 300 330
じっとしてた 10 100 110
合計 40 400 440
コレを
ナマズ 地震 頻度
騒いだ あった 30
騒いだ なかった 300
じっとしてた あった 10
じっとしてた なかった 100
こうする
13
分割表でGLM
ナマズ 地震 頻度
騒いだ あった 30
騒いだ なかった 300
じっとしてた あった 10
じっとしてた なかった 100
サンプルサイズは4
データは正数値
ポアソン回帰でOK
14
分割表でGLM
ナマズ 地震 頻度
騒いだ あった 30
騒いだ なかった 10
じっとしてた あった 10
じっとしてた なかった 390
もしもナマズが「有意に」
効果を持っているなら……
地震が起こるによる頻度の影響
ナマズが騒ぐとき → +20の補正
ナマズがじっとしてるとき → -380の補正
ナマズの行動によって、地震の影響が変化する
15
分割表でGLM
ナマズ 地震 頻度
騒いだ あった 30
騒いだ なかった 10
じっとしてた あった 10
じっとしてた なかった 390
もしもナマズが「有意に」
効果を持っているなら……
ナマズの行動によって、地震の影響が変化する
変数同士が交互に影響を与え合っている
交互作用
16
まとめ
ナマズ
地震
あった なかった 合計
騒いだ 30 300 330
じっとしてた 10 100 110
合計 40 400 440
分割表を
ナマズ 地震 頻度
騒いだ あった 30
騒いだ なかった 300
じっとしてた あった 10
じっとしてた なかった 100
データフレームに変換
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