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Análisis filogenético de
la familia Sonalaceae
-Comparación de morfología de
frutos-
Objetiv
o
Descripció
n
Pregunt
a
En este proyecto se evaluó la
similaridad entre los frutos de
diferentes géneros de la familia
Solanaceae con base a sus relaciones
filogenéticas
¿Los frutos de la familia Solanaceae
que tienen características morfológicas
similares están más relacionados
filogenéticamente?
Analizar las relaciones filogenéticas entre géneros seleccionados de la
familia Solanaceae y su influencia en el tipo de fruto.
Comprenden aproximadamente 98 géneros y unas 2700 especies, con una
gran diversidad de hábito, morfología y ecología. En el orden Solanales hay
algunas de las sinapomorfías como: tubo polínico con calosa; cáliz
persistente en el fruto. Entre sus géneros más importantes está: Solanum,
Lyciantes , Cestrum, Nicotiana, Physalis & Lycium. Esta familia es de gran
importancia alimenticia, ya que presenta especies como: la papa (Solanum
tuberosum), el tomate (Solanum lycopersicum), la berenjena (Solanum
melongena), el pimentón (Capsicum annuu), entre otros
Orden: Solanales
Clase: Eudicotyledoneae
Phylum: Magnoliophyta
Introducció
n
Familia Solanaceae
Su fruto es de tipo baya o cápsula, y con menor frecuencia drupa
(Lycium ameghinoi)
Compuestos activos
Fruto que se forma de dos o más
carpelos. La liberación de semillas
se realiza mediante aberturas
longitudinales o a través de poros
apicales
Introducció
n
Baya
Se forma de uno o varios carpelos,
cada uno de estos contiene
numerosas semillas. Su capa
interna es carnosa
Cápsula Drupa
Se forma de uno o varios carpelos,
pero cada carpelo contiene una
semilla. Su capa externa es carnosa
y la interna es pétrea, esta última
está bien adherida a la semilla
Introducció
n
International Solanaceae Genomics Project (SOL)
Systems Approach to Diversity and Adaptation
• ¿Cómo puede un conjunto común de genes/proteínas dar lugar a una gama tan amplia de organismos
morfológica y ecológicamente distintos que ocupan nuestro planeta?
• ¿Cómo se puede aprovechar una comprensión más profunda de la base genética de la diversidad para
satisfacer mejor las necesidades de la sociedad de una manera respetuosa con el medio ambiente?
Busca respuesta a dos preguntas:
El Proyecto de Secuenciación del Tomate, primer pilar del Proyecto Internacional Solanáceas (SOL)
Introducció
n
Gen
rbcL
Gen
matK
Codifica una proteína que forma
parte de la enzima RuBisCO, que es
fundamental en el ciclo de Calvin
para catalizar la fijación del dióxido
de carbono durante la fase oscura de
la fotosíntesis
Gen cloroplástico que codifica para
una subunidad de la ATP sintasa, una
enzima involucrada en la síntesis de
ATP (trifosfato de adenosina) en las
células vegetales.
Presente en todo el reino Plantae
rbcL
mat
K
• Solanum lycopersicum
• Capsicum annuum
• Physalis peruvian
• Nicotiana tabacum
• Brugmansia arborea
• Atropa belladona
• Mandragora autumnalis
• Hyoscyamus niger
• Datura wrightii
• Brunfelsia pauciflora
• Cestrum nocturnum
• Salpichroa origanifolia
• Scopolia carniolica
• Withania somnifera
Metodología
Metodología
Alineamiento concatenado
Mejor
modelo
Secuencias
Las relaciones obtenidas en el árbol filogenético
de máxima verosimilitud usando estos dos
genes coinciden en la mayoría de ocasiones con
el tipo y morfología de los frutos de los géneros
de la familia Solanaceae
Resultados
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Cápsula
Cápsula
Cápsula
Cápsula
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Bay
a
Discusió
n
El género Whitania y Physalis se observan estrechamente relacionados y se
confirma con su tipo de baya, además de su desarrollo con vesícula costillada de
color verde el cual es procedente del cáliz y envuelve el fruto
El bajo porcentaje de carnosidad de la baya de Capsicum annuum, se refleja en su
relación con las especies de tipo cápsula
Las especies relacionadas con mayor bootstrap fueron Datura y Brugmansia, a
pesar de presentar diferente tipo de fruto; esto se puede deber a que realmente
estos dos géneros tienen características muy similares en cuanto a flor, hoja,
compuestos activos como alcaloides neurotóxicos y propiedades organolépticaas
como el olor. De esta manera se afirma que el fruto no es el único caracter que
asegura una relación a nivel filogenético.
Los géneros Hyoscyamus y Scopolia presentaron un boostrap alto
y esto se refleja en su desarrollo de cáliz acrescente y en el tipo de
fruto que es una cápsula tipo pixidio, dado su método de apertura
para ambos. Estos dos géneros se relacionaron bastante con
Atropa, el cual aunque es una baya, presenta un crecimiento de
cáliz prominente y se asemeja al largo de los anteriores, pero con
diferente direccionalidad.
Los géneros Cestrum y Brunfelsia presentaron un Bootstrap de 70,
lo que significa que esta agrupación tiene cierto nivel de
confiabilidad. Ambos frutos son de tipo baya con alto contenido de
alcaloides, lo que las hace plantas tóxicas, especialmente el fruto,
sin embargo, estos dos géneros no comparten muchas
características morfológicas y probablemente se agruparon de esta
manera por falta de géneros similares, ya que incluso pertenecen a
subfamilias diferentes.
Conclusió
n
Los géneros más relacionados filogenéticamente encontrados en este árbol, comparten el mismo tipo de
fruto a excepción de Datura y Brugmansia, también comparten otras características morfológicas
relacionadas con la flor y otras partes de la planta, sin embargo para hacer un análisis filogenético más
robusto entre géneros de la familia Solanaceae y compararlo con la morfología del fruto se necesita más
información e incluir una mayor cantidad de géneros al análisis, ya que esta es una familia muy diversa
que comprende aproximadamente 98 géneros y unas 2700 especies .
Referencia
s
• Mueller LA, Tanksley SD, Giovannoni JJ, van Eck J, Stack S, Choi D, Kim BD, Chen M, Cheng Z, Li C, Ling H, Xue Y, Seymour G, Bishop G, Bryan G, Sharma R, Khurana J, Tyagi A,
Chattopadhyay D, Singh NK, Stiekema W, Lindhout P, Jesse T, Lankhorst RK, Bouzayen M, Shibata D, Tabata S, Granell A, Botella MA, Giuliano G, Frusciante L, Causse M, Zamir
D. The Tomato Sequencing Project, the first cornerstone of the International Solanaceae Project (SOL). Comp Funct Genomics. 2005;6(3):153-8.
• Rätsch C. The encyclopedia of psychoactive plants. Rochester, Vermont: Park Street Press; 2005.
• Smith, N. (2023). Solanaceae. In Amazon Fruits: An Ethnobotanical Journey (pp. 1221-1249). Cham: Springer International Publishing.
• Mueller, L. A., Solow, T. H., Taylor, N., Skwarecki, B., Buels, R., Binns, J., ... & Tanksley, S. D. (2005). The SOL Genomics Network. A comparative resource for Solanaceae biology
and beyond. Plant physiology, 138(3), 1310-1317.
• (Srivastava, R. P., Saxena, G., Singh, L., Singh, A., Verma, P. C., & Kaur, G. (2022). Interspecific and intraspecific analysis of Selinum spp. collected from Indian Himalayas using
DNA barcoding. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology, 20(1)https://doi.org/10.1186/s43141-022-00345-0)
• (Lim et al. 2007, Silberfeld et al. 2014, Parente y Saunders 2019, Oteng'o y Won 2020).
• Monro, A. (2012). Eight new species of cestrum (solanaceae) from mesoamerica. PhytoKeys, 8, 49-82. doi:https://doi.org/10.3897/phytokeys.8.2238

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  • 1. Análisis filogenético de la familia Sonalaceae -Comparación de morfología de frutos-
  • 2. Objetiv o Descripció n Pregunt a En este proyecto se evaluó la similaridad entre los frutos de diferentes géneros de la familia Solanaceae con base a sus relaciones filogenéticas ¿Los frutos de la familia Solanaceae que tienen características morfológicas similares están más relacionados filogenéticamente? Analizar las relaciones filogenéticas entre géneros seleccionados de la familia Solanaceae y su influencia en el tipo de fruto.
  • 3. Comprenden aproximadamente 98 géneros y unas 2700 especies, con una gran diversidad de hábito, morfología y ecología. En el orden Solanales hay algunas de las sinapomorfías como: tubo polínico con calosa; cáliz persistente en el fruto. Entre sus géneros más importantes está: Solanum, Lyciantes , Cestrum, Nicotiana, Physalis & Lycium. Esta familia es de gran importancia alimenticia, ya que presenta especies como: la papa (Solanum tuberosum), el tomate (Solanum lycopersicum), la berenjena (Solanum melongena), el pimentón (Capsicum annuu), entre otros Orden: Solanales Clase: Eudicotyledoneae Phylum: Magnoliophyta Introducció n Familia Solanaceae Su fruto es de tipo baya o cápsula, y con menor frecuencia drupa (Lycium ameghinoi) Compuestos activos
  • 4. Fruto que se forma de dos o más carpelos. La liberación de semillas se realiza mediante aberturas longitudinales o a través de poros apicales Introducció n Baya Se forma de uno o varios carpelos, cada uno de estos contiene numerosas semillas. Su capa interna es carnosa Cápsula Drupa Se forma de uno o varios carpelos, pero cada carpelo contiene una semilla. Su capa externa es carnosa y la interna es pétrea, esta última está bien adherida a la semilla
  • 5. Introducció n International Solanaceae Genomics Project (SOL) Systems Approach to Diversity and Adaptation • ¿Cómo puede un conjunto común de genes/proteínas dar lugar a una gama tan amplia de organismos morfológica y ecológicamente distintos que ocupan nuestro planeta? • ¿Cómo se puede aprovechar una comprensión más profunda de la base genética de la diversidad para satisfacer mejor las necesidades de la sociedad de una manera respetuosa con el medio ambiente? Busca respuesta a dos preguntas: El Proyecto de Secuenciación del Tomate, primer pilar del Proyecto Internacional Solanáceas (SOL)
  • 6. Introducció n Gen rbcL Gen matK Codifica una proteína que forma parte de la enzima RuBisCO, que es fundamental en el ciclo de Calvin para catalizar la fijación del dióxido de carbono durante la fase oscura de la fotosíntesis Gen cloroplástico que codifica para una subunidad de la ATP sintasa, una enzima involucrada en la síntesis de ATP (trifosfato de adenosina) en las células vegetales. Presente en todo el reino Plantae
  • 7. rbcL mat K • Solanum lycopersicum • Capsicum annuum • Physalis peruvian • Nicotiana tabacum • Brugmansia arborea • Atropa belladona • Mandragora autumnalis • Hyoscyamus niger • Datura wrightii • Brunfelsia pauciflora • Cestrum nocturnum • Salpichroa origanifolia • Scopolia carniolica • Withania somnifera Metodología
  • 9. Las relaciones obtenidas en el árbol filogenético de máxima verosimilitud usando estos dos genes coinciden en la mayoría de ocasiones con el tipo y morfología de los frutos de los géneros de la familia Solanaceae Resultados Bay a Bay a Bay a Bay a Cápsula Cápsula Cápsula Cápsula Bay a Bay a Bay a Bay a Bay a Bay a
  • 10. Discusió n El género Whitania y Physalis se observan estrechamente relacionados y se confirma con su tipo de baya, además de su desarrollo con vesícula costillada de color verde el cual es procedente del cáliz y envuelve el fruto El bajo porcentaje de carnosidad de la baya de Capsicum annuum, se refleja en su relación con las especies de tipo cápsula Las especies relacionadas con mayor bootstrap fueron Datura y Brugmansia, a pesar de presentar diferente tipo de fruto; esto se puede deber a que realmente estos dos géneros tienen características muy similares en cuanto a flor, hoja, compuestos activos como alcaloides neurotóxicos y propiedades organolépticaas como el olor. De esta manera se afirma que el fruto no es el único caracter que asegura una relación a nivel filogenético.
  • 11. Los géneros Hyoscyamus y Scopolia presentaron un boostrap alto y esto se refleja en su desarrollo de cáliz acrescente y en el tipo de fruto que es una cápsula tipo pixidio, dado su método de apertura para ambos. Estos dos géneros se relacionaron bastante con Atropa, el cual aunque es una baya, presenta un crecimiento de cáliz prominente y se asemeja al largo de los anteriores, pero con diferente direccionalidad. Los géneros Cestrum y Brunfelsia presentaron un Bootstrap de 70, lo que significa que esta agrupación tiene cierto nivel de confiabilidad. Ambos frutos son de tipo baya con alto contenido de alcaloides, lo que las hace plantas tóxicas, especialmente el fruto, sin embargo, estos dos géneros no comparten muchas características morfológicas y probablemente se agruparon de esta manera por falta de géneros similares, ya que incluso pertenecen a subfamilias diferentes.
  • 12. Conclusió n Los géneros más relacionados filogenéticamente encontrados en este árbol, comparten el mismo tipo de fruto a excepción de Datura y Brugmansia, también comparten otras características morfológicas relacionadas con la flor y otras partes de la planta, sin embargo para hacer un análisis filogenético más robusto entre géneros de la familia Solanaceae y compararlo con la morfología del fruto se necesita más información e incluir una mayor cantidad de géneros al análisis, ya que esta es una familia muy diversa que comprende aproximadamente 98 géneros y unas 2700 especies .
  • 13. Referencia s • Mueller LA, Tanksley SD, Giovannoni JJ, van Eck J, Stack S, Choi D, Kim BD, Chen M, Cheng Z, Li C, Ling H, Xue Y, Seymour G, Bishop G, Bryan G, Sharma R, Khurana J, Tyagi A, Chattopadhyay D, Singh NK, Stiekema W, Lindhout P, Jesse T, Lankhorst RK, Bouzayen M, Shibata D, Tabata S, Granell A, Botella MA, Giuliano G, Frusciante L, Causse M, Zamir D. The Tomato Sequencing Project, the first cornerstone of the International Solanaceae Project (SOL). Comp Funct Genomics. 2005;6(3):153-8. • Rätsch C. The encyclopedia of psychoactive plants. Rochester, Vermont: Park Street Press; 2005. • Smith, N. (2023). Solanaceae. In Amazon Fruits: An Ethnobotanical Journey (pp. 1221-1249). Cham: Springer International Publishing. • Mueller, L. A., Solow, T. H., Taylor, N., Skwarecki, B., Buels, R., Binns, J., ... & Tanksley, S. D. (2005). The SOL Genomics Network. A comparative resource for Solanaceae biology and beyond. Plant physiology, 138(3), 1310-1317. • (Srivastava, R. P., Saxena, G., Singh, L., Singh, A., Verma, P. C., & Kaur, G. (2022). Interspecific and intraspecific analysis of Selinum spp. collected from Indian Himalayas using DNA barcoding. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology, 20(1)https://doi.org/10.1186/s43141-022-00345-0) • (Lim et al. 2007, Silberfeld et al. 2014, Parente y Saunders 2019, Oteng'o y Won 2020). • Monro, A. (2012). Eight new species of cestrum (solanaceae) from mesoamerica. PhytoKeys, 8, 49-82. doi:https://doi.org/10.3897/phytokeys.8.2238