3. Deep Learningのバイオデータでの活躍
• Deep Learningを生物データに適用させて成功し
た研究は既にある
– Using Convolutional Neural Networks (CNNs) to learn the functional activity of DNA sequences
(Basset package, Kelley et al. (2016)
– Predicting effects of noncoding DNA (DeepSEA, Zhou & Troyanskaya (2015))
– Investigating the regulatory role of RNA binding proteins in alternative splicing (Alipanahi et al.,
2015)
• こういった研究はシーケンスデータ対象であり、
CNNやRNNが適用しやすい