関西おうちハック関西おうちハック　エクステンデッドvol.5 @ロックオフにて行ったLTの資料です

1. IoTのカンファレンスに参加したら
なぜかバイオにはまった話
Takao Ikoma
Nov. 21, 2015

2. SOLID2014
● O'Reilly がIoTの会議をやるというので参加
● 航空券はマイレージ利用
●
キーノートで数人が"Synthetic Biology"に言及
する
● 気になった

3. SOLID2015
● http://solidcon.com/internet-of-things-2015
● 前回おもしろかったので、稼ぎもないのにまた
参加
● 航空券はクレジットーカードのポイントで
● 下流老人まっしぐら
● "Synthetic Biology"が1セッションになってい
る

4. キーノートでJoiがバイオ推し!
● Bio is New Digital!
● http://www.youtube.com/embed/pnHD8gvccpI
● Mooreの法則 < 次世代シーケンサの進化(5倍?)
●
ヒトゲノム・プロジェクト: 1988-2001(2003) 13年、3000億円
● 1000ドルゲノム・プロジェクト: 数日と1000ドル、最新機種ではほぼ達成
●
エレクトロニクスで過去50年に起こった進化が今、バイオで
● Biology: Discovery → Design
● 観察、分析の科学から工学へ
● 薬品、医療、食品、燃料、材料、環境

5. デジタル・バイオロジー
● DNA
● バイオ・インフォマティクス
● システム生物学
● スーパーコンピュータ創薬
● 「虫」が苦手でも大丈夫

6. クラウド・バイオ実験環境
Emerald Cloud Labs
● http://emeraldcloudlab.com/
● 実験プロトコルをプログラミング言語で記述
●
クラウドに投げたらロボットが実験!
● データ解析までして返してくれる

7. バイオ実験プロトコル記述言語
Antha
● http://www.antha-lang.org/
● Flow-based Programming Language
● 次元を含む型チェック
●
クラス：固体/液体/気体、実験器具
● 実験の再現性を高める
●
論文の実験で再現できたのは10数パーセント

8. ちょっと調べてみたら

9. キッチン・バイオ
ストリート・バイオ
● OpenPCR
● http://openpcr.org/
●
鳥人間社のDNA ”増幅器である NinjaPCR”
– http://healthtechnews.jp/2013/12/05/dna_pcr/
– http://healthtechnews.jp/wp-content/uploads/2013/12/slide-8-1024.jpg
– IVSのLaunch Padで2位!
● DIY CRISPR Kits on Indiegogo
● https://www.indiegogo.com/projects/diy-crispr-kits-learn-modern-science-by-doing#/
● https://youtu.be/TWthRz-0T18
● 細胞培養キット
● http://techable.jp/archives/32468?utm_content=buffer55cde&utm_medium=social&utm_sour
●
バイオハッカージャパンhttp://biohacker.jp/
● 自宅遺伝子診断に向けて電気泳動槽自作中

10. Glowing Plant Project
●
遺伝子組換えで樹木を光らせる!?
● KickstarterではGMOプロジェクトは禁止に
● http://www.theverge.com/2013/8/2/4583562/kickstarter-bans-project-creators-from-giving-GMO-re
● 日本のアカデミアでもやってる
●
カルタヘナ条約は貿易戦争!
● 米国は批准していない

11. Genome Compiler
● http://synbiobeta.com/programming-in-four-bits-genome-compiler/

12. CRISPR/cas9
● http://www.huffingtonpost.jp/daiki-horikawa/genome_b_8248478.html

13. バイオのオープンデータはガチ!
● DNA、遺伝子、タンパク質、代謝、化学物
質、...
ピンク： ライフサイエンス

14. バイオのポスドクが減り始めた
● http://www.nature.com/news/massive-pool-of-us-biomedical-postdocs-starts-to-shrink-1.18632
●
スタートアップへ流れ始めている?

15. 「細胞を創る」研究会
● http://www.jscsr.org/
● 合成生物学
● 分子ロボティクス

16. DNA Origami
http://www.chem-station.com/blog/2014/06/dna-5.html

17. ワトソンでガン診断
● http://gigazine.net/news/20150507-ibm-watson-cancer-care/
●
白血病だけで89タイプ
● 2000万件の医学論文

18. 3Dバイオ・プリンター
● 歯、骨は実用化
● http://hbol.jp/27584
● 再生医療に向けて他の臓器も
http://techon.nikkeibp.co.jp/article/FEATURE/20141208/393196/?P=4

19. 医工連携
● CTデータをお腹の上にプロジェクションマッ
ピングして内視鏡手術
● http://smcb.jp/column/detail/6721701/
● https://www.youtube.com/watch?v=cNzDflddL-A
● 手術ロボット「ダ・ヴィンチ」
● http://www.intuitivesurgical.com/jp/aboutdavinci.html
● 私の時代は生物学、医学は別世界

20. ブロックチェーンでラボノート?
● Astroblocks
● http://www.newsbtc.com/2015/09/20/blockchain-technology-for-scientific-research-and-development/

21. CTなどの医用画像データから臓器
のモデリングする
● http://fabble.cc/junkyinc/dicomstl
● http://fabble.cc/chihirovv/printingthebrain
● http://www.dezeen.com/2015/11/04/mit-media-la

22. デザイン+合成生物学
● https://www.ted.com/talks/neri_oxman_design_at_the_intersection_of_technology_and_biology