Kobe.R #15 - Incanter ﾁｮｯﾄｼｯﾃﾙ

Incanter ﾁｮｯﾄｼｯﾃﾙ
@tnoda_
Kobe.R #15
[2015-02-28 Sat]

Incanter を知っていますか? (N=100)

Incanter を知っていますか? (N=100)
No
(100)

円グラフなのはいけないと思います
しかも 3D 円グラフ！

＿人人人人人人人人＿
＞　3D pie chart　＜
￣ＹＹＹＹＹＹＹＹ￣

Incanter で 3D 円グラフを書く方法を知らない。

R ソースコード
3D 円グラフの書き方
1 install.packages("plotrix", dependencies = TRUE)
2 library(plotrix)
3 sls <- c(100)
4 lbls <- c("Non(100)")
5 pie3D(sls , labels = lbls)

R ソースコード
3D 円グラフの書き方
1 install.packages("plotrix", dependencies = TRUE)
2 library(plotrix)
3 sls <- c(100)
4 lbls <- c("Non(100)")
5 pie3D(sls , labels = lbls)
R 終了のお知らせ
本日の発表で R のはなしがでてくるのは、これが最後です。

Outline
Incanter の構成
• プラットフォーム／ツール
• R との比較
Incanter の使い方
• インストール／環境構築
• データの取扱い

Incanter の構成要素
!"#$%&'(
)#*&+,#'(#-
.,'/&0(+
123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+

!"#$%&'(
)#*&+,#'(#-
.,'/&0(+
123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+
!
!
!
.;.<<
=,+-+4#

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123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+
!
!
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.;.<<
=,+-+4#
.0,>"+(
.0,>"+(
?@A
?4*4

Incanter とは
Incanter の本体は何かというと

Incanter とは
• Clojure ライブラリである。

Incanter とは
Incanter を使うということは
• Clojure ライブラリを使うということ、すなわち、

Incanter とは
Incanter を使うということは
• Clojure ライブラリを使うということ、すなわち、
• Clojure プログラミングをすることである。

Incanter の実体
!"#$%&'(
)#*&+,#'(#-
.,'/&0(+
123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+
!
!
!
.;.<<
=,+-+4#
.0,>"+(
.0,>"+(
?@A
?4*4

Incanter の実体
!"#$%&'(
)#*&+,#'(#-
.,'/&0(+
123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+
!
!
!
.;.<<
=,+-+4# .0,>"+(
.0,>"+(
?@A
?4*4
9#:4#-(+

Clojure とは
プログラミング言語、開発環境、エコシステム、・・・
!"#"
$!%&'(')*+,-
.)/0123456768
60"2
9)/!123
9/:;*)32
<=>?
9/))3.@*/A
?*+2"27
9/A.1223A.7
?*+2"27

Clojure のコンパイラ
Java とは異なる文法
• 前置記法
• 表現力豊かなリテラル
型推論
int a = 4;
マクロ
• 強力な機能、力の源泉
• 使いこなせば、プログラミングではなくプログラミング言語
を操ることができる。

Clojure と Java の文法の違い
Java の Java メソッド呼び出し
obj.aMethod(arg0 , arg1 , ...);
AClass.staticMethod(arg0 , arg1 , ...);
Clojure の Java メソッド呼び出し
(. method obj arg0 arg1 ...)
(AClass/staticMethod arg0 arg1 ...)
Clojure の Clojure 関数呼び出し
(func arg0 arg1 ...)

マクロ（並）の例
ネストした式
(reduce + (filter valid? (map f coll )))

ネストした式
• 見にくい。書きにくい。括弧多い。

ネストした式
スレッディングマクロ（組み込み）
(->> coll
(map f)
(filter valid?)
(reduce +))

ネストした式
スレッディングマクロ（組み込み）
(->> coll
(map f)
(filter valid?)
(reduce +))
• dplyr %>% dplyr %>% dplyr

Clojure あれこれ
REPL
> (+ 1 2)
3
> (defn f [x] (cond (zero? x) 0 (= 1 x) 1 :else (+ (f (
dec x)) (f (- x 2)))))
#’sandbox24497/f
> (f 11)
89

REPL
> (+ 1 2)
3
dec x)) (f (- x 2)))))
#’sandbox24497/f
> (f 11)
89
コレクションライブラリ
スレッドセーフ、高速な永続コレクション

REPL
> (+ 1 2)
3
dec x)) (f (- x 2)))))
#’sandbox24497/f
> (f 11)
89
コレクションライブラリ
スレッドセーフ、高速な永続コレクション
並行実行ライブラリ
多コアマシンの性能を限界まで引き出す。

Incanter の総合力
!"#$%&'(
)#*&+,#'(#-
.,'/&0(+
123#-456
7&8+4+3
! 9#:4#-(+
!
!
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.;.<<
=,+-+4# .0,>"+(
.0,>"+(
?@A
?4*4
9#:4#-(+

Workflow
!"#"
$%&'()
*+,&# -&#,&#./#0%+ 1
.'),'%()22 3+"4/252

Workflow
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*+,&# -&#,&#./#0%+ 1
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!"#"
$%&'()
-&#,&#*+("+#)'674%8&')

Integration
!"#
$%#
&%' ()*++,
-,)./ -0+.1

Integration
!"#
$%#
&%' ()*++,
-,)./ -0+.1
234)305.

Checkpoint 1
Incanter とは
• Clojure ライブラリ

Checkpoint 1
Incanter とは
Clojure とは
• Java + 強化ライブラリ (clojure-x.y.z.jar)
• 文法, REPL, 高速永続コレクション, 並行実行, マクロ

Checkpoint 1
Incanter とは
Clojure とは
• Java + 強化ライブラリ (clojure-x.y.z.jar)
• 文法, REPL, 高速永続コレクション, 並行実行, マクロ
Incanter の総合力
• R + Python
• Integration

How to install Incanter (1/2)
Java
• パッケージ管理ツールでインストールするのが簡単
• Debian 系 Linux
$ sudo apt-get install openjdk-7-jdk
• Oracle のサイトからダウンロード
• http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/
downloads/index.html

Java
• パッケージ管理ツールでインストールするのが簡単
• Debian 系 Linux
$ sudo apt-get install openjdk-7-jdk
• Oracle のサイトからダウンロード
• http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/
downloads/index.html
Clojure
• Leiningen をインストールする
• 実体はシェルスクリプトなのでダウンロードするだけ
$ curl -L -O https://raw.githubusercontent.com/
technomancy/leiningen/stable/bin/lein
$ chmod +x lein

Incanter
• 公式サイトのダウンロードリンク
• http://incanter.org/downloads/

Incanter
罠。インストール駄目、絶対

Incanter
罠。インストール駄目、絶対
より正確には
• とにかく古い
• Leiningen が必要な Java/Clojure ライブラリを管理
• もちろん、その中に Incanter が含まれる
• 明示的なインストール作業不要

Local Maven Repository
!"#
$%&%
'()*+,-
$%&%
'()*+,-
./)*0(+
'()*+,-
./)*0(+
'()*+,-

Incanter Project
Create a new Clojure project
$ lein new tnoda.kobexr.demo
コマンドラインから lein new プロジェクト名で作成
Add Incanter to dependencies
プロジェクトファイルに [incanter "1.5.6"] を追加
(defproject tnoda.kobexr.demo "0.1.0-SNAPSHOT"
:description "FIXME: write description"
:url "http://example.com/FIXME"
:license {:name "Eclipse Public License"
:url "http://www.eclipse.org/legal/epl-v10.html"}
:dependencies [[org.clojure/clojure "1.6.0"]
[incanter "1.5.6"]
[nz.ac.waikato.cms.weka/weka-dev "3.7.11"]])

Checkpoint 2
Incanter のインストール

Checkpoint 2
Java
• パッケージマネージャ (dpkg, Homebrew)
• オラクルのサイトからダウンロード

Checkpoint 2
Java
Clojure
• Leiningen をインストール
• 実体はシェルスクリプト。コピーするだけ。

Checkpoint 2
Java
Clojure
• Leiningen をインストール
• 実体はシェルスクリプト。コピーするだけ。
Incanter
• インストールしてはいけない。
• Leiningen にライブラリの管理を任せる。

Getting started with Incanter
データフレーム（Incanter 用語では dataset）をつくるところから始めるのは R と同じ。
デフォルトのデータセットから
(ds/get-dataset :iris)
ファイルから
(i/read-dataset "http://example.com/data.csv"
:header true)

Graphing
R-like
(def chart
(c/scatter-plot ($ :Petal.Width iris)
($ :Petal.Length iris)
:title "Edgar␣Anderson ’s␣Iris␣Data"))
(i/view chart)
Clojure-way
(i/with-data iris
(i/view
(c/scatter-plot :Petal.Width :Petal.Length
:title "Edgar␣Anderson ’s␣Iris␣Data"
)))

まとめ
データセットをつくる
R でデータフレームつくるのと同じ

まとめ
グラフィクス・統計解析
R と同じような関数が用意されている

まとめ
Incanter でできないものは?

Incanter の不可能を可能にする

問い
R にできて Incanter にできないものを Incanter で実現するに
はどうすればよいか?

問い
答え
Incanter と R をつないで、Incanter から R を使えるようにす
ればよい。

問い
答え
Incanter と R をつないで、Incanter から R を使えるようにす
ればよい。
Example (Solution)
• Rserve
• http://www.rforge.net/Rserve/

Rserve
!"#$%#
!
&'()*$#
&'+#,-
./0%01
2,30,-#$

Rserve/Clojure
(r/plot3d [100] :labels ["Non(100)"])
No
(100)

Checkpoint 3
Incanter の利用
• だいたい R と同じ。
• データフレームを作るところから始める。
• Incanter ではデータセットと呼ぶ。

Checkpoint 3
Incanter の利用
• データフレームに対して処理を行う。
• R と同じような関数が用意されている。

Checkpoint 3
Incanter の利用
• データフレームに対して処理を行う。
• R と同じような関数が用意されている。
R にしか無い機能は
• Rserve で R を Incanter から使う

Conclusion
Incanter とは
• R みたいに使える、

Conclusion
Incanter とは
• Clojure のライブラリ

Conclusion
Incanter とは
Clojure とは
• Java

Conclusion
Incanter とは
Clojure とは
• Java
• REPL, コンパイラ, 並行ライブラリ, マクロ

Conclusion
Incanter とは
Clojure とは
• Java
• マルチコアの時代のプログラミング言語

Conclusion
Incanter とは
Clojure とは
• Java
• マルチコアの時代のプログラミング言語
Incanter で 3D 円グラフを描くには
• Rserve を使って R に描かせる。

Kobe.R #15 - Incanter ﾁｮｯﾄｼｯﾃﾙ

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