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beispiele von Alzheimer’s und AIDS




vineeth surendranath, doktorand, gruppe tomancak
                                                               was hat Informatik zu tun mit Krankheiten ?




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1996   1997   1997      1998                1999                 2000
1954                                      1978                                             1995
       “Wir alle haben Angst verrückt zu sein. Wie sollten wir es auch wissen, die, die im Kopf leben ?”
Zentrales Dogma der Molekularbiologie




Gene   RNA




       Protein
Thomas H Morgan & seine Fruchtfliegen
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 gene
                  1           2                     3       4
           exon
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                                            1   3       4



           protein
                                      protein
RNA interferenz



 gene
                  1       2                     3       4
           exon
mRNA
       1      2       3       4
                              mRNA
                                        1   3       4



           protein
                                  protein
RNA interferenz
RNA interferenz

                   dsRNA
        DICER


                   siRNA pool
   RISC protein
   components


                   RISC
        siRNA
     unwinding


                   Activated RISC
association with
   target mRNA



  target mRNA
      cleavage
Molekulare Ursache für Alzheimer’s




    APP               ↓
                      β-secretase(BACE1)


APPsβ                       ↓     β-stub
                            γ-secretase




                    Aβ Aβ
              Aβ Aβ
                          Aβ
RNA interferenz




    APP!    "!
             !-secretase!


APPs!!             "!         !-stub!
                   #-secretase!



                 A!! A!!
             A!!
           A!!          A!!
RNA interferenz




25000 gene   200
Numerische Mathematik, Vol. 1, 269-271, 1959




              5



1   2         3                           4



    6
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1   2   3     4



    6


            1 2 3
            1 7 3
            1 6 3
Protein Netzwerk im Alzheimer’s
HIV genome
"Wenn ich weiter sehen konnte, so deshalb, weil ich auf den Schultern von Riesen stand."
                                                                        Isaac Newton
Frank Buchholz              Ralf Kittler                  Janet Chusainow Jitin Bali                               Lawrence Rajendran
Gruppenleiter               Assistant Professor           Wissenschaftler    Doktorand, Psychiatrische Forschung   Professor, Psychiatrische Forschung
MPI-CBG, Dresden            Southwestern Medical Center   MPI-CBG, Dresden   Universität Zürich                    Universität Zürich
                            Texas Universität, USA




                   "Wenn ich weiter sehen konnte, so deshalb, weil ich auf den Schultern von Riesen stand."
                                                                                                                                         Isaac Newton

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  • 2. “... Ein Beweis für die Widerstandsfähigkeit des menschlichen Kreativität” Crutch, Isaacs & Rossor, Lancet 2001 Selbstportrait, William Utermohlen (1967)
  • 3. Selbstportraits, William Utermohlen (1933-2006) 1996 1997 1997 1998 1999 2000
  • 4. 1954 1978 1995 “Wir alle haben Angst verrückt zu sein. Wie sollten wir es auch wissen, die, die im Kopf leben ?”
  • 5. Zentrales Dogma der Molekularbiologie Gene RNA Protein
  • 6. Thomas H Morgan & seine Fruchtfliegen
  • 7. Zentrales Dogma der Molekularbiologie gene 1 2 3 4 exon mRNA 1 2 3 4 mRNA 1 3 4 protein protein
  • 8. RNA interferenz gene 1 2 3 4 exon mRNA 1 2 3 4 mRNA 1 3 4 protein protein
  • 10. RNA interferenz dsRNA DICER siRNA pool RISC protein components RISC siRNA unwinding Activated RISC association with target mRNA target mRNA cleavage
  • 11. Molekulare Ursache für Alzheimer’s APP ↓ β-secretase(BACE1) APPsβ ↓ β-stub γ-secretase Aβ Aβ Aβ Aβ Aβ
  • 12. RNA interferenz APP! "! !-secretase! APPs!! "! !-stub! #-secretase! A!! A!! A!! A!! A!!
  • 14.
  • 15. Numerische Mathematik, Vol. 1, 269-271, 1959 5 1 2 3 4 6
  • 16. 7 5 1 2 3 4 6 1 2 3 1 7 3 1 6 3
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  • 18.
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  • 24. "Wenn ich weiter sehen konnte, so deshalb, weil ich auf den Schultern von Riesen stand." Isaac Newton
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