Recommended
Recommended
More Related Content
Featured
Featured (20)
植生調査資料Db
- 1. 植生調査資料データベースの構築 と公開に向けて W21 オープンデータと生 態学 2015／3／21 17：30-19： 30 兵庫県立人と自然の博物館 橋本佳延 研究者からのオープンデータへの期待2
- 2. 植生調査資料とは？ • 植物群落（植生）の 組成と構造、立地条 件を記述した観測 データ • 在・不在データだけ でなく、サイズ（群 落高・階層高）や量 （階層の植被率、各 出現種の被度）を記 録
- 3. 調査方法・記録書式 は概ね統一されてい る 日本で行われている植生調査で は、 ① 立地条件の記録（斜面方位、 傾斜、地形等） ② 階層の把握 ③ 階層高・階層の植被率の把 握 ④ 各階層の出現種のリスト アップ ⑤ 各階層の出現種の被度の測 定（目測） の順で行われる。 ※被度の測定法はブラン-ブラン
- 4. 植生調査資料をデータベース化、 公開することの意義 • 検索を容易にし、資料へのアクセス性を高める • 過去の自然環境（植生）の状態を知る手がかりを広く社会で 共有 – 植生遷移の研究の発展に寄与 • 現在の植生の状態を共有 – 地域の生物多様性の保全や活用の基礎資料 • 観察記録ではあるが、種の分布情報として活用可能（誤同定 が含まれる可能性があることを認識した上で利用） – 生物地理学への貢献 • 資料管理者では発想できない、新たな活用方法を発見する 可能性を高め
- 5. 現在、データベース化をすすめてい る 植生調査資料 • 神戸大学 植生学研究室（武田義明名誉教 授：平成24年度退官）に保管されていた植生 調査資料約7,000点→博物館に寄贈という形 • 故 杉田隆三 賢明女子学院短期大学教授の 植生調査資料→博物館に寄贈という形 • 人と自然の博物館の地域環境調査で得られた 植生調査資料 著作権の問題はクリアしているデータ
- 11. ＤＢに入力する前に すべき処理
- 12. データベースに入力する前に 行わなければならない処理 • 筆記文字の判読 – 筆跡の癖、汚れ・かすれなど読み取りが難しいものの判断 • 誤字・脱字の修正 – 筆記者の聞き間違いがそのまま筆記されているものがある • 種名の統一 – 異名や地方名で書かれているものを標準和名に変換 • 住所の特定 – 市町村名の省略など抜けの補完、特定の地名しか書かれていない場合、住所 を地図から読み取る（例 ○○神社、○○公園）→小字まで判断できる – 複数の市町村にまたがるような地名（例 ○○山）などは住所を特定できない 場合がある • 緯度・経度の判読 – 調査地点の記入された地形図が保管されている場合、緯度・経度を読み取る
- 14. デジタル情報にして DB構築
- 15. デジタル情報としてデータベース 化 • 武田名誉教授がかつて 開発した植生解析ソフ ト（basicで作成）を使 用 – 過去のデータの蓄積が あるため、それを活か すため • 入力データをDB形式 で出力するためのコン バータも存在するが、 DB公開できる形式に するには改良が必要 • 現在はコンバートする 前段階までの処理を進
- 16. ここまでの処理での課題 • 文字判読出来ないものの扱い – 現状では「不明」として処理 • 種名の記入誤り（聞き間違い）の扱い – 現状では「不明」として処理 • 不完全データの扱い – 調査年月日または調査者名が欠落したものは除外 – 位置情報は３次メッシュレベルで判断できるよう なものはDBに登録する（緯度経度情報がなくて も小字までの住所がわかれば含める）
- 17. 公開方法は？
- 18. 選択肢①－原票画像をDB公開－ • 調査地点情報と原票画像を紐付け • 種組成情報はデジタル化せず • メリット – 入力作業や判読作業が大幅に減らせ る – 博物館のもつ既存のDBシステムを活 用できる • デメリット – スキャン作業に手間 – 資料としての利便性が低い（利用者 が労力をさく必要） • 原票文字の判読 • 種名統一 • 種組成データのデータベース化
- 19. 選択肢②－ＷＥＢで検索・ＤＬ可能 なＤＢ • メリット – 資料としての利便性の 向上 • デメリット – イニシャルコスト大 （システム構築・サー バー設置） – ランニングコスト大 （ＩＴ技術の発展に合 わせたシステム更新。 メンテナンス。セキュ リティ対策） – 入力作業が膨大 http://vegedb.hitohaku.ne.jp/search_form/ 入力・編集・削除 種分布検索 調査票検索 ユーザー管理 文献名 都道府県 調査日 年 月 日～ 年 月 日 階層 種名（前方一致） 被度 被度（％） 被度はいずれかを入力 群度 検索条件を設定しない場合は全件表示されます。 上記の全てのデータをダウンロードします。 ダウンロードデータの説明はここをご覧ください。？ ＤＬリストにチェックを入れ、ＤＬリスト作成ボタンを押すと、 ダウンロードする調査票のリストが一覧表示されます。 Copy Right 2013, Museum of Nature and Human Activities,Hyogo Revised ＤＬリスト作成 文献名群落名 ＤＬリスト 検索 全選択ダウンロード 地点ＩＤ 都道府県 市町村以下住所 year 植生データベース 調査票検索 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18
- 21. • ＤＢ設置・維持にはヒト・モノ・カネが 必要 – 突き詰めると資金。 – 原資は税金？ 寄付？ 利用者負担？ • 植生調査資料が蓄積されていても、公開され ていなければ活用できず、ほとんど無意味 • 植生調査資料が活用されても、管理者が社会 的に賞賛されなければ続かない • データ提供者が賞賛される仕組みがなければ、 リアルタイムにデータが集まらない